ImmunePathwayLists(WGCNA)
ImmunePathwayLists()所属R语言包:WGCNA
Immune Pathways with Corresponding Gene Markers
免疫途径与相应的基因标记
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This matrix gives a predefined set of marker genes for many immune response pathways, as assembled by Brian Modena (a member of Daniel R Salomon's lab at Scripps Research Institute), and colleagues. It is used with userListEnrichment to search user-defined gene lists for enrichment.
这个矩阵给出了一组预定义的标记基因,对于许多免疫反应的途径,布赖恩摩德纳(斯克里普斯研究所的成员丹尼尔ŕSalomon的实验室),和他的同事组装。它是用来与userListEnrichment搜索用户定义的基因列表富集。
用法----------Usage----------
data(ImmunePathwayLists)
格式----------Format----------
A 3597 x 2 matrix of characters containing Gene / Category pairs. The first column (Gene) lists genes corresponding to a given category (second column). Each Category entry is of the form <Immune Pathway>__ImmunePathway. Note that the matrix is sorted first by Category and then by Gene, such that all genes related to the same category are listed sequentially.
一个3597×2矩阵的字符,包含基因/类别对。的第一列(基因)的列表对应于一个给定的类别(第二列)的基因。每个分类条目是在的形式<Immune Pathway> __ImmunePathway的。请注意,矩阵排序第一个类别,然后通过基因的同一类别的所有相关基因的顺序列出。
源----------Source----------
For more information about this list, please see userListEnrichment
有关此列表的更多信息,请参阅userListEnrichment
实例----------Examples----------
data(ImmunePathwayLists)
head(ImmunePathwayLists)
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注:
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