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R语言 ChIPpeakAnno包 TSS.zebrafish.Zv8()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 14:50:36 | 显示全部楼层 |阅读模式
TSS.zebrafish.Zv8(ChIPpeakAnno)
TSS.zebrafish.Zv8()所属R语言包:ChIPpeakAnno

                                         TSS annotation data for zebrafish (Zv8) obtained from biomaRt
                                         斑马鱼(Zv8)TSS的注释数据从biomaRt获得

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

TSS annotation data for zebrafish (Zv8) obtained from biomaRt
斑马鱼(Zv8)TSS的注释数据从biomaRt获得


用法----------Usage----------


data(TSS.zebrafish.Zv8)



格式----------Format----------

RangedData with slot start holding the start position of the gene, slot end holding the end position of the gene, slot rownames holding ensembl gene id and slot space holding the chromosome location where the gene is located. In addition, the following variables are included.
与插槽RangedData开始控股持有该基因的结束位置的基因,槽年底开始位置,槽rownames,控股ENSEMBL基因ID和插槽空间,持有该基因位于染色体上的位置。此外,包括下列变量。




strand 1 for positive strand and -1 for negative strand
strand1正股负链-1




description description of the gene
description描述的基因


Details

详情----------Details----------

Annotation data obtained by:
注释数据得到:

mart = useMart(biomart = "ensembl", dataset = "drerio_gene_ensembl")
沃尔玛= useMart(biomart =“ENSEMBL”,集“drerio_gene_ensembl”)

getAnnotation(mart, featureType = "TSS")
getAnnotation(集市,featureType =“TSS的”)


举例----------Examples----------


data(TSS.zebrafish.Zv8)
slotNames(TSS.zebrafish.Zv8)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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