R语言 ChIPpeakAnno包 translatePattern()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

translatePattern(ChIPpeakAnno)
translatePattern()所属R语言包：ChIPpeakAnno

                                         translate pattern from IUPAC Extended Genetic Alphabet to regular expression
                                         从国际化联遗传扩展字母的正则表达式转换模式

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

translate pattern containing the IUPAC nucleotide ambiguity codes to regular expression.  For example,Y->[C|T], R-> [A|G], S-> [G|C], W-> [A|T],         K-> [T|U|G], M-> [A|C], B-> [C|G|T], D-> [A|G|T], H-> [A|C|T], V-> [A|C|G] and N-> [A|C|T|G].
包含正则表达式的IUPAC核苷酸的模糊代码转换模式。例如，Y  - > [D | T]，R  - > [| G】，S  - >【G]，W  - > [| T]，K  - > [T | üG】的M-> [|]，B  - >论文集[C | G | T]，D  - > [| G |的牛逼]，H  - > [| C | T] V-> | C | G】和N-[| C | T | G]。


用法----------Usage----------


translatePattern(pattern)



参数----------Arguments----------

参数：pattern
a character vector with the IUPAC nucleotide ambiguity codes  
与特征向量的IUPAC核苷酸的模糊代码


值----------Value----------

a character vector with the pattern represented as regular expression
为代表的正则表达式的模式与特征向量


作者（S）----------Author(s)----------



Lihua Julie Zhu




参见----------See Also----------

countPatternInSeqs, summarizePatternInPeaks
countPatternInSeqs，summarizePatternInPeaks


举例----------Examples----------


        pattern1 = "AACCNWMK"
        translatePattern(pattern1)

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注：
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