addAncestors(ChIPpeakAnno)
addAncestors()所属R语言包:ChIPpeakAnno
Add GO ids of the ancestors for a given vector of GO ids
去一个好IDS向量的祖先IDS
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Add GO ids of the ancestors for a given vector of GO ids leveraging GO.db package
一个好IDS利用GO.db包的向量去祖先的ID
用法----------Usage----------
addAncestors(go.ids, ontology = c("bp", "cc", "mf"))
参数----------Arguments----------
参数:go.ids
matrix with 4 columns: first column is GO IDs and 4th column is entrez IDs.
矩阵的4列:第一列是好身份证和第4列是Entrez的标识。
参数:ontology
bp for biological process, cc for cellular component and mf for molecular function
BP生物过程,分子功能的单元成分和MF的CC
值----------Value----------
a vector of GO IDs containing the input GO IDs with the GO IDs of their ancestors added
一个好标识的向量输入自己祖先的好标识的ID添加
作者(S)----------Author(s)----------
Lihua Julie Zhu
举例----------Examples----------
go.ids = cbind(c("GO:0008150", "GO:0005576", "GO:0003674"),c("ND", "IDA", "ND"),
c("BP", "BP", "BP"), c("1", "1", "1"))
addAncestors(go.ids, ontology="bp")
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