R语言 ChemmineR包 bonds()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

bonds(ChemmineR)
bonds()所属R语言包：ChemmineR

                                         Bonds, charges and missing hydrogens
                                         债券，收费和失踪的氢

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns information about bonds, charges and missing hydrogens in SDF and SDFset objects.
传回有关债券，收费及失踪氢SDF和SDFset对象的信息。


用法----------Usage----------


bonds(x, type = "bonds")



参数----------Arguments----------

参数：x
SDF or SDFset containers  
SDF或SDFset容器


参数：type
If type="bonds" (default), a data.frame is returned with columns: atom (atom labels), Nbondcount (observed bond count), Nbondrule (bond count according to position in periodic table) and charge (charge of each atom).   If type="charge", all charged atoms are returned and if type="addNH", the number of missing hydrogens are returned for each molecule.   
如果type="bonds"（默认），data.frame同列返回：atom（原子标签），Nbondcount（观察到的债券数量），Nbondrule（债券计数根据周期表的位置）和charge（每个原子的电荷）。如果type="charge"，所有带电原子返回，如果type="addNH"，失踪的氢的数量为每个分子返回。


Details

详情----------Details----------

It is used by many other functions (e.g. MW, MF, atomcount, atomcuntMA and plot) to correct for missing hydrogens that are often not specified in SD files.
它被用于许多其他功能（例如MW，MF，atomcount，atomcuntMA和plot）纠正缺少的，往往没有指定的氢SD文件。


值----------Value----------

If x is of class SDF, then a single data.frame or vector is returned. If x is of class SDFset, then a list of data.frames or vecotors is returned that has the same length and order as x.
如果x类SDF，然后一个单一的data.frame或vector返回。如果x类SDFset，的list或data.frames返回具有相同的长度和作为vecotors为了x。


作者（S）----------Author(s)----------



Thomas Girke




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

Functions: conMA
功能：conMA

Class: SDF and SDFset
类别：SDF和SDFset


举例----------Examples----------


## Instances of SDFset class[＃实例SDFset类，]
data(sdfsample)
sdfset <- sdfsample

## Returns data frames with bonds and charges [＃数据框返回债券和收费]
bonds(sdfset[1:2], type="bonds")

## Returns charged atoms in each molecule[＃返回带电原子在每个分子]
bonds(sdfset[1:2], type="charge")

## Returns the number of missing hydrogens in each molecule[＃返回失踪的氢的数量在每个分子]
bonds(sdfset[1:2], type="addNH")


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