R语言 ChemmineR包 atomsubset()函数中文帮助文档(中英文对照)

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atomsubset(ChemmineR)
atomsubset()所属R语言包：ChemmineR

                                         Subset SDF/SDFset Objects by Atom Index to Obtain Substructure
                                         原子指数的一个子集自卫队/ SDFset的对象来获取子结构

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to obtain a substructure from SDF/SDFset objects by providing a row index for the atom block in an SDF referencing the atoms of interest. The function subsets both the atom and bond block(s) accordingly.
从自卫队/ SDFset对象提供自卫队引用感兴趣的原子在原子块行指数函数来获取子结构。功能子集原子和债券块（S）相应。


用法----------Usage----------


atomsubset(x, atomrows, datablock = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：x
object of class SDFset or SDF  
对象的类SDFset或SDF


参数：atomrows
The argument atomrows can be assigned a numeric index referencing the atoms in the atom block of x. If x is of class SDF, the index needs to be provided as vector. If x is of class SDFset, the same number of index vectors as molecules stored in x need to be passed on in a list with component names identical to the component (molecule) names stored in x.   
参数atomrows可以分配一个数字索引引用在x的原子块的原子。如果x类SDF，该指数需要为vector。 x如果类是SDFset，相同数量的指数向量存储在分子x需要通过列表中的组件名称相同的组件（分子）命名存储x。


参数：datablock
By default the data block(s) in SDF/SDFset objects are removed after atom subsetting. The setting datablock=TRUE will maintain the data block information in the subsetted result.  
默认情况下，数据块（S）SDF/SDFset对象被删除后，原子的子集。设置datablock=TRUE将保持在子集的结果数据块信息。


Details

详情----------Details----------

...
...


值----------Value----------

object of class SDF or SDFset
对象的类SDF或SDFset


作者（S）----------Author(s)----------



Thomas Girke




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

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举例----------Examples----------


## Instance of SDFset class[＃SDFset类的实例]
data(sdfsample)
sdfset <- sdfsample

## Subset one or more molecules with atom index(es) to obtain substructure(s)[＃子集的一个或多个分子与原子指数（ES），以获得子（S）]
atomsubset(sdfset[[1]], atomrows=1:18)
indexlist <- list(1:18, 1:12)
names(indexlist) <- cid(sdfset[1:2])
atomsubset(sdfset[1:2], atomrows=indexlist)

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