R语言 charm包 getControlIndex()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getControlIndex(charm)
getControlIndex()所属R语言包：charm

                                         Get indices of control probes from CpG-free regions
                                         从CpG免费的区域指标控制探针

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Get indices of control probes from CpG-free regions.
从CpG免费的区域指标控制探针。


用法----------Usage----------


getControlIndex(dat, controlProbes = NULL, noCpGWindow = 1000, subject, onlyGood = FALSE, matrix = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：dat
TilingFeatureSet  
TilingFeatureSet


参数：controlProbes
vector of names used to denote control probes in the 'container' column of the Nimblegen annotation (ndf) file. Optional  
矢量控制探针用来表示NimbleGen的注解（NDF）文件中的“容器”列名。可选


参数：noCpGWindow
Size of the window centered on the probe that must be CpG-free  
窗口的大小集中在探针必须CpG免费的


参数：subject
A BSgenome object  
一个BSgenome对象


参数：onlyGood
deprecated option  
废弃的选项


参数：matrix
deprecated option  
废弃的选项


Details

详情----------Details----------

The probes can either be identified as control probes in the microarray annotation package, or alternatively the function will search the genome (given an appropriate BSgenome object) for suitable probes.
确定探针可以控制探针在芯片注解包，或者功能将寻找合适的探针基因组（给予适当的BSgenome对象）。


值----------Value----------

a vector
向量


作者（S）----------Author(s)----------



Martin Aryee <aryee@jhu.edu>




举例----------Examples----------


# See dmrFdr[看到dmrFdr]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。