predictqrrvglm(VGAM)
predictqrrvglm()所属R语言包:VGAM
Predict Method for a CQO fit
的CQO合适的预测方法
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Predicted values based on a constrained quadratic ordination (CQO) object.
预测的基础上有约束的二次协调(CQO)对象的值。
用法----------Usage----------
predictqrrvglm(object, newdata=NULL,
type = c("link", "response", "lv", "terms"),
se.fit = FALSE, deriv = 0, dispersion = NULL,
extra = object@extra, varlvI = FALSE, reference = NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数:object
Object of class inheriting from "qrrvglm".
对象的类继承自"qrrvglm"。
参数:newdata
An optional data frame in which to look for variables with which to predict. If omitted, the fitted linear predictors are used.
一个可选的数据框中寻找变量,用以预测。如果省略该参数,拟合的线性预测。
参数:type, se.fit, dispersion, extra
See predictvglm.
见predictvglm。
参数:deriv
Derivative. Currently only 0 is handled.
衍生工具。目前,只有0处理。
参数:varlvI, reference
Arguments passed into Coef.qrrvglm.
传递参数到Coef.qrrvglm。
参数:...
Currently undocumented.
目前没有证件。
Details
详细信息----------Details----------
Obtains predictions from a fitted CQO object. Currently there are lots of limitations of this function; it is unfinished.
从一个装有CQO对象获取的预测。目前有此功能的限制,它是未完成的。
值----------Value----------
See predictvglm.
见predictvglm。
注意----------Note----------
This function is not robust and has not been checked fully.
此功能是不健全的,并没有完全得到遏制。
(作者)----------Author(s)----------
T. W. Yee
参考文献----------References----------
A new technique for maximum-likelihood canonical Gaussian ordination. Ecological Monographs, 74, 685–701.
参见----------See Also----------
cqo.
cqo。
实例----------Examples----------
hspider[,1:6]=scale(hspider[,1:6]) # Standardize the environmental variables[标准化的环境变量]
set.seed(1234)
# vvv p1 = cqo(cbind(Alopacce, Alopcune, Alopfabr, Arctlute, Arctperi, Auloalbi,[VVV P1 = cqo(CBIND(Alopacce,Alopcune,Alopfabr,Arctlute,Arctperi,Auloalbi]
# vvv Pardlugu, Pardmont, Pardnigr, Pardpull, Trocterr, Zoraspin) ~[VVV Pardlugu,Pardmont,Pardnigr,Pardpull,Trocterr,Zoraspin)~]
# vvv WaterCon + BareSand + FallTwig + CoveMoss + CoveHerb + ReflLux,[VVV WaterCon + BareSand + FallTwig + CoveMoss + CoveHerb + ReflLux,]
# vvv fam=poissonff, data=hspider, Crow1positive=FALSE, ITol=TRUE)[VVV FAM = poissonff,数据hspider,Crow1positive = FALSE,ITol = TRUE)]
# vvv sort(p1@misc$deviance.Bestof) # A history of all the iterations[的VVV排序(P1 @杂项$ deviance.Bestof)#A历史上所有的迭代]
# vvv head(predict(p1))[VVV头(预测(P1))]
# The following should be all zeros[下面列出的是所有零]
# vvv max(abs(predict(p1, new=head(hspider)) - head(predict(p1))))[VVV最大(ABS(预测(P1,新的=的头(hspider)) - 头(预测(P1))))]
# vvv max(abs(predict(p1, new=head(hspider), type="res") - head(fitted(p1))))[VVV最大(ABS(预测(P1,新的=的头(hspider),“水库”) - 头(装(P1))))]
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