R语言 CGHregions包 CGHregions-package()函数中文帮助文档(中英文对照)

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CGHregions-package(CGHregions)
CGHregions-package()所属R语言包：CGHregions

                                         Dimension Reduction for Array CGH Data with Minimal Information Loss.
                                         阵列CGH数据信息损失最小的尺寸减少。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

CGHregions takes as input array CGH data (log2-ratios) that have been segmented (i.e., split into chromosomal segments of similar log2-ratios) and called (i.e., a copy number assigned to each segment) on a per-sample basis and adjusts the segmentation so that break-points that are in similar locations across multiple samples are set to be in identical locations. Segmented and called data can be obtained by using the CGHcall package. The resulting dimensionality reduction facilitates downstream analysis in a variety of ways (e.g., reduces severity of multiple hypothesis testing, facilitates clustering and visualization, reduces computer memory requirements).
CGHregions作为输入阵列CGH数据（log2比）已分段（即分成类似的log2比染色体片段），并要求对每一个样本的基础上（即一个拷贝数分配到各分部）和调整分割，所以，突破点，在多个样品的类似场所设置在相同的位置。可以得到使用CGHcall包分割和所谓的数据。在各种不同的方式（例如，降低了多种假设检验的严重性，有利于聚类和可视化，减少了计算机内存的要求）所产生的降维有利于下游分析。


Details

详情----------Details----------


作者（S）----------Author(s)----------



Mark van de Wiel and Sjoerd Vosse
Maintainer: Mark van de Wiel <mark.vdwiel@vumc.nl>




参考文献----------References----------

with Minimal Information Loss. Cancer Informatics, 2, 55-63.
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注：
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