CGHnormaliter-package(CGHnormaliter)
CGHnormaliter-package()所属R语言包：CGHnormaliter
This package implements the CGHnormaliter algorithm which is a strategy for improved normalization of array Comparative Genomic Hybridization (aCGH) data
这个包实现了CGHnormaliter算法，这是一个阵列比较基因组杂交（aCGH）数据改善标准化的战略
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
CGHnormaliter is an iterative algorithm for normalization of aCGH data displaying imbalanced aberrations. First, provisory balanced copy numbers are identified and subsequently used for normalization based on LOWESS. These two steps are then iterated to refine the normalization. The assumption here is that the temporary exclusion of aberrations allows for a more appropriate calculation of the LOWESS regression curve. As a result, after normalization, the log2 intensity ratios of the normals will generally be closer to zero and better reflect the biological reality.
CGHnormaliter是一个迭代算法aCGH数据显示不平衡畸变标准化。首先，provisory平衡的拷贝数的确定和随后标准化基础上LOWESS。这两个步骤，然后迭代完善的标准化。这里的假设是，允许一个更合适的的LOWESS回归曲线计算像差的临时排除。标准化后，作为一个结果，法线的log2强度的比值一般会接近于零，更好地反映生物的现实。
Details
详情----------Details----------
The package contains two public functions. The function CGHnormaliter performs the iterative normalization of aCGH data, while the function CGHnormaliter.write.table prints normalized aCGH data to a file. See function documentation for details.
该软件包包含两个公共职能。的功能CGHnormaliter执行迭代aCGH数据标准化，而功能CGHnormaliter.write.table归aCGH数据打印到一个文件。有关详细信息，请参阅功能文件。
作者（S）----------Author(s)----------
Bart P.P. van Houte, Thomas W. Binsl, Hannes Hettling
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
CGHcall, DNAcopy
CGHcall，DNAcopy
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注：
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发表于 2012-2-25 14:37:03
