mergeMCRProbes(cghMCR)
mergeMCRProbes()所属R语言包:cghMCR
A function that appends probe ids to a data frame containing MCRs
一个功能追加IDS探测到的数据框包含MCRS
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function takes a data frame generated by MCR and then append probe ids corresponding to each MCR as a column to the data frame.
此功能需要一个数据框生成MCR和再追加探针IDS相应的MCR作为列数据框到每个。
用法----------Usage----------
mergeMCRProbes(mcr, rawData)
参数----------Arguments----------
参数:mcr
mcr is a data frame generated by MCR that contains MCRs identified and other related data
mcr是一个数据框产生MCR包含的MCRS确定和其他相关数据
参数:rawData
rawData is a data frame with at least three columns. The first column should be probe ids, second the chromosome number the probes corresponding to, and the thrid the starting or ending chromosomal locations of the probes
rawData是一个至少有三列的数据框。第一列应该是探针IDS,第二染色体数目对应的探针,和thrid探针的开始或结束的染色体位置
Details
详情----------Details----------
The mcr data frame passed must have the first column for chromosome numbers, the 7th column for the starting positions of the MCRs, and the 8th column for the ending positions of the MCRs.
mcr数据框通过,必须有染色体数目的第一列的,MCRS的起始位置的7列,8列MCRS结束位置。
值----------Value----------
A data frame with MCRs and the corresponding probe ids and other data.
与MCR和相应的探针ID和其他数据的数据框。
注意----------Note----------
The function is a contribution of The Center for Applied Cancer
该函数是一个应用癌症中心的贡献
作者(S)----------Author(s)----------
Jianhua Zhang
参见----------See Also----------
MCR
MCR
举例----------Examples----------
data("segData")
cghmcr <- cghMCR(segData, gapAllowed = 500, alteredLow = 0.20,
alteredHigh = 0.80, recurrence = 50)
mcrs <- MCR(cghmcr)
mcrs <- mergeMCRProbes(mcrs, segData[["data"]])
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