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R语言 verification包 verify()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-10-1 15:23:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
verify(verification)
verify()所属R语言包:verification

                                        Verification function
                                         验证功能

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Based on the type of inputs, this function calculates a range of verification statistics and skill scores. Additionally, it creates a verify  class object that can be
的输入的类型的基础上,此函数计算的核查统计和技能分数的范围内。此外,它会创建一个校验类的对象,可以


用法----------Usage----------


    verify(obs, pred, baseline = NULL,
           frcst.type = "prob", obs.type = "binary",  thresholds =
seq(0,1,0.1), show = TRUE, bins = TRUE, ... )



参数----------Arguments----------

参数:obs
The values with which the verifications are verified. May be a vector of length 4 if the forecast and predictions are binary data summarized in a contingency table.  In this case, the value are entered in the order of c(n11, n01, n10, n00). If  obs is a matrix, it is assumed to be a contingency table with observed values summarized in the columns and forecasted values summarized in the rows.  
值的核查验证。可能是一个矢量的长度为4,如果预报和预测的应急表中总结的二进制数据。在这种情况下,该值被输入的顺序的c(N11,N01,N10,N00)。如果观测值是一个矩阵,它被假定为是一个应变与观察到的值的表中总结的列和行中总结的预测值。


参数:pred
Prediction of event.  The prediction may be in the form of the a point prediction or the probability of a forecast.  Let pred = NULL if obs is a contingency table.  
预测的事件。可能只有一个点预测或预测的概率的形式预测。让PRED = NULL如果obs为联表。


参数:baseline
In meteorology, climatology is the baseline that represents the no-skill forecast.  In other fields this field would differ.  This field is used to calculate certain skill scores.  If left NULL, these statistics are calculated using sample climatology.  If this is not NULL, the mean of these values is used as the baseline forecast.  This interpretation is not appropriate for all applications.  For example, if a baseline forecast is different for each forecast this will not work appropriately.   
在气象学,气候学的基线,无技能的预测。在其他领域,这个领域将会有所不同。此字段用于计算一定的技巧得分。如果左NULL,这些统计数据来计算样品的气候。如果这不是NULL,则使用这些值的平均值作为基线预测。这种解释是不适合于所有的应用程序。例如,如果一个基线预测是不同的每个预测这将无法正常工作正确。


参数:frcst.type
Forecast type.  Either "prob", "binary", "norm.dist", "cat" or "cont".  Defaults to "prob". "norm.dist" is used when the forecast is in the form of a normal distribution.  See crps for more details.  
预测类型。无论是“概率”,“二”,“norm.dist”,“猫”或“CONT”。默认为“概率”。 “norm.dist”时使用的预测是在一个正常的分布的形式。更多详细信息,请参阅CRPS达。


参数:obs.type
Observation type.  Either  "binary", "cat" or "cont".  Defaults to "binary"
观察类型。无论是“二”,“猫”或“CONT”。默认设置为“binary”


参数:thresholds
Thresholds to be considered for point forecasts of continuous events.
被认为是阈值点的连续事件的预测。


参数:show
Binary; if TRUE (the default), print warning message
二进制TRUE(默认设置),打印警告消息


参数:bins
Binary; if TRUE (default), the probabilistic forecasts are placed in bins defined by the sequence defined in threshold and assigned the midpoint value.
二进制,如果是TRUE(默认),被放置在垃圾桶定义的序列中定义的阈值和分配的中点值的概率预报。


参数:...
Additional options.
附加选项。


Details

详细信息----------Details----------

See Wilks (2006) and the WMO Joint WWRP/WGNE Working Group web site on verification for more details about these verification statistics.  See Stephenson et al. (2008) and Ferro and Stephenson (2011) for more on the extreme dependence scores and indices.  For information on confidence intervals for these scores, see Gilleland (2010).
威尔克斯(2006年)的WMO WWRP / WGNE联合工作组的网站上核实有关详细信息,对这些检验统计。见斯蒂芬森等。 (2008年),铁和斯蒂芬森(2011年)的极度依赖分数和指数。这些成绩的置信区间的信息,请参阅Gilleland(2010年)。


值----------Value----------

An object of the verify class.  Depending on the type of data used, the following information may be returned.  The following notation is used to describe which values are produced for which type of forecast/observations. (BB = binary/binary, PB = probablistic/binary, CC = continuous/continuous, CTCT = categorical/categorical)   
verify类的一个目的。根据所使用的数据的类型,下面的信息可能被返回。下面的符号是用来描述的是哪种类型的预测/观测值。 (BB =二进制/二进制,PB = probablistic /二进制,CC =连续/连续,CTCT =分类/分类)


参数:BS
Brier Score (PB)
野蔷薇分数(PB)


参数:BSS
Brier Skill Score(PB)
野蔷薇技能分数(PB)


参数:SS
Skill Score (BB)
技术得分(BB)


参数:hit.rate
Hit rate, aka PODy, $h$ (PB, CTCT)
命中率,又名PODy,$ H $(PB,CTCT)


参数:false.alarm.rate
False alarm rate, PODn, $f$ (PB, CTCT)
误报率,PODn,$ F $(PB,CTCT)


参数:TS
Threat Score or Critical Success Index (CSI)(BB, CTCT)  
威胁的得分或成功的关键指数(CSI)(BB,CTCT)


参数:ETS
Equitable Threat Score (BB, CTCT)
公正预兆得分(BB,CTCT)


参数:BIAS
Bias (BB, CTCT)  
偏置(BB,CTCT)


参数:PC
Percent correct or hit rate (BB, CTCT)
正确或命中率(BB,CTCT)


参数:Cont.Table
Contingency Table (BB)
列联表(BB)


参数:HSS
Heidke Skill Score(BB, CTCT)  
Heidke技能分数(BB,CTCT)


参数:KSS
Kuniper Skill Score (BB)
Kuniper技能分数(BB)


参数:PSS
Pierce Skill Score (CTCT)  
的皮尔斯技能分数(CTCT)


参数:GS
Gerrity Score (CTCT)  
Gerrity分数(CTCT)


参数:ME
Mean error (CC)  
平均误差(CC)


参数:MSE
Mean-squared error (CC)
均方误差(CC)


参数:MAE
Mean absolute error (CC)
平均绝对误差(CC)


参数:theta
Odds Ratio (BB)
比值比(BB)


参数:log.theta
Log Odds Ratio
登录比值比


参数:n.h
Degrees of freedom for log.theta (BB)
(BB)的自由度log.theta


参数:orss
Odds ratio skill score, aka Yules's Q (BB)
赔率比技能得分,又名公共秩序的Q(BB)


参数:eds
Extreme Dependency Score (BB)
极端依赖分数(BB)


参数:eds.se
Standard Error for Extreme Dependence Score (BB)
标准错误为极度依赖分数(BB)


参数:seds
Symmetric Extreme Dependency Score (BB)
对称极端依赖分数(BB)


参数:seds.se
Standard Error for Symmetric Extreme Dependency Score (BB)
标准错误对称极端依赖分数(BB)


参数:EDI
Extremal Dependence Index (BB)
极值依赖指数(BB)


参数:EDI.se
Standard Error for Extremal Dependence Index (BB)
标准误差为的极值相关指数(BB)


参数:SEDI
Symmetric Extremal Dependence Index (BB)
对称的极值相关指数(BB)


参数:SEDI.se
Standard Error for Symmetric Extremal Dependence Index (BB)
标准错误对称的极值相关指数(BB)


注意----------Note----------

There are other packages in R and Bioconductor which are usefull for verification tasks.  This includes the ROCR, ROC, package and the "limma" package (in the Bioconductor repository.)  Written by people in different fields, each provides tools for verification from  different perspectives.
还有其他的包在R和Bioconductor是有用的验证任务。这包括的ROCR,ROC,包“limma”的包(在的Bioconductor资料库。)不同领域的人写的,每个提供了从不同的角度进行验证的工具。

For the categorical forecast and verification, the Gerrity score only makes sense for forecast that have order, or are basically ordinal. It is assumed that the forecasts are listed
对于分类预测和验证,Gerrity得分的预测是有道理的,有秩序,或基本上序。据推测,预测列出


(作者)----------Author(s)----------


Matt Pocernich <pocernic@ucar.edu>



参考文献----------References----------








参见----------See Also----------

table.stats
table.stats


实例----------Examples----------


# binary/binary example[二进制/二进制的例子]
obs<- round(runif(100))
pred<- round(runif(100))

# binary/binary example[二进制/二进制的例子]
# Finley tornado data.[芬利的龙卷风的数据。]

obs<- c(28, 72, 23, 2680)
A<- verify(obs, pred = NULL, frcst.type = "binary", obs.type = "binary")

summary(A)

# categorical/categorical example[类别/分类的例子]
# creates a simulated 5 category forecast and observation.[5类创建一个模拟预测和观察。]
obs <- round(runif(100, 1,5) )
pred <- round(runif(100, 1,5) )

A<- verify(obs, pred, frcst.type = "cat", obs.type = "cat" )
summary(A)

#  probabilistic/ binary example[概率/二进制的例子]

pred<- runif(100)
A<- verify(obs, pred, frcst.type = "prob", obs.type = "binary")
summary(A)

# continuous/ continuous example[连续/连续的例子]
obs<- rnorm(100)
pred<- rnorm(100)
baseline <- rnorm(100, sd = 0.5)

A<- verify(obs, pred, baseline = baseline,  frcst.type = "cont", obs.type = "cont")
summary(A)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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