R语言 vegclust包 plot.mvegclust()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plot.mvegclust(vegclust)
plot.mvegclust()所属R语言包：vegclust

                                         Plots clustering results
                                         图的聚类结果

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create plots used to study vegclust clustering results for an increasing number of clusters
创建图使用，研究vegclust聚类结果，越来越多的聚类


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'mvegclust'
plot(x, type="hnc", excludeFixed=TRUE, verbose=FALSE, ylim=NULL, xlab=NULL, ylab=NULL, maxvar=0.6, minsize=20,...)



参数----------Arguments----------

参数：x
An object returned from functions hier.vegclust or random.vegclust.
返回的对象从功能hier.vegclust或random.vegclust。


参数：type
A string indicating the type of plot desired. Current accepted values are "hnc","hmemb","var","hcs" and "valid".
一个字符串，指示所需的类型图。目前接受的价值观是“HNC”，“hmemb”，“无功”，“HCS”和“有效”。


参数：excludeFixed
A flag to indicate whether clusters with fixed centroids should be excluded from plots.
一个标志，表示从图是否聚类与固定的重心应被排除在外。


参数：verbose
A flag to print extra information.
一个标志，打印额外的信息。


参数：ylim
A vector with the limits for the y axis.
一个向量为y轴的限制。


参数：xlab
String label for the x axis.
String为x轴的标签。


参数：ylab
String label for the y axis.
String为y轴的标签。


参数：maxvar
Maximum cluster variance allowed for the type="valid" plot.
最大允许的方差为type="valid"图。


参数：minsize
Minimum cluster size allowed for the type="valid" plot.
最小的簇大小允许type="valid"图。


参数：...
Additional plotting parameters.
额外的绘图参数。


值----------Value----------

Different information is returned depending on the type of plot chosen.
不同的信息，则返回取决于选择的类型的图。


（作者）----------Author(s)----------



Miquel De C谩ceres, Forest Science Center of Catalonia




实例----------Examples----------


# Loads data  [数据加载]
data(wetland)
  
# This equals the chord transformation (see also 'normalize' option in \code{\link{decostand}} from the vegan package)[这等于和弦转换（参见标准化选项\ {\的链接{decostand}}从素食包的代码）]
wetland.chord = as.data.frame(sweep(as.matrix(wetland), 1, sqrt(rowSums(as.matrix(wetland)^2)), "/"))

# Create noise clustering from hierarchical clustering at different number of clusters[在不同的层次聚类簇数产生噪音聚类]
wetland.hc = hclust(dist(wetland.chord),method="ward")
wetland.nc = hier.vegclust(wetland.chord, wetland.hc, cmin=2, cmax=5, m = 1.2, dnoise=0.75, method="NC")

# Plot changes in the number of objects falling into the noise cluster[图变化的对象的数量落入噪音聚类]
plot(wetland.nc, type="hnc")

# Plots the number of objects falling into "true" clusters, the number of objects considered intermediate, [图解落入“true”的聚类，认为是中间的对象的数目的对象的数目，]
# and the number of objects falling into the noise[的对象的数量落入噪音]
plot(wetland.nc, type="hmemb")

# Plot minimum, maximum and average cluster size[图最小，最大和平均簇大小]
plot(wetland.nc, type="hcs")

# Plot minimum, maximum and average cluster variance[图最小，最大和平均方差]
plot(wetland.nc, type="var")

# Plot number of groups with high variance, low membership or both[高方差，低的成员或两者的组数与图]
plot(wetland.nc, type="valid")

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