R语言 vegclust包 hier.vegclust()函数中文帮助文档(中英文对照)

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hier.vegclust(vegclust)
hier.vegclust()所属R语言包：vegclust

                                         Clustering with several number of clusters
                                         ，聚类与几个聚类数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Performs several runs of function 'vegclust' on a community data matrix using different number of clusters
执行多次运行，的社区数据矩阵功能的vegclust使用不同数量的聚类


用法----------Usage----------


hier.vegclust(x, hclust, cmin=2,cmax=20, verbose=TRUE, ...)
random.vegclust(x, cmin=2, cmax=20, nstart=10, verbose=TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
Community data table. A site (rows) by species (columns) matrix or data frame.
社区数据表。种（列）矩阵或数据框的站点（行）。


参数：hclust
A hierarchical clustering represented in an object of type hclust.
一个层次聚类代表的对象类型hclust。


参数：cmin
Number of minimum mobile clusters.
数的最小移动聚类。


参数：cmax
Number of maximum mobile clusters.
数最大的移动聚类。


参数：nstart
A number indicating how many random trials should be performed for each number of groups
一个数字，表示每个组数多少应进行随机试验


参数：verbose
Flag used to print which number of clusters is currently running.
标志用于打印当前正在运行的群数。


参数：...
Additional parameters for function vegclust.
其他参数功能vegclust。


Details

详细信息----------Details----------

Function hier.vegclust takes starting cluster configurations from cuts of a dendrogram given by object hclust. Function random.vegclust chooses random objects as cluster centroids and for each number of clusters performs nstart trials.
函数hier.vegclust需要启动聚类配置从一个树状对象hclust削减。函数random.vegclust作为聚类中心随机选择的对象，并为每个数字聚类执行nstart试验的。


值----------Value----------

Returns an object of type 'mvegclust' (multiple vegclust), which contains a list vector with objects of type vegclust.
返回对象类型mvegclust“（多vegclust），其中包含一个列表向量的对象类型vegclust。


（作者）----------Author(s)----------



Miquel De C谩ceres, Forest Science Center of Catalonia




参见----------See Also----------

vegclust,vegclass,defuzzify,hclust
vegclust，vegclass，defuzzify，hclust


实例----------Examples----------



# Loads data  [数据加载]
data(wetland)
  
# This equals the chord transformation (see also 'normalize' option in \code{\link{decostand}} from the vegan package)[这等于和弦转换（参见标准化选项\ {\的链接{decostand}}从素食包的代码）]
wetland.chord = as.data.frame(sweep(as.matrix(wetland), 1, sqrt(rowSums(as.matrix(wetland)^2)), "/"))

# Create noise clustering from hierarchical clustering at different number of clusters[在不同的层次聚类簇数产生噪音聚类]
wetland.hc = hclust(dist(wetland.chord),method="ward")
wetland.nc1 = hier.vegclust(wetland.chord, wetland.hc, cmin=2, cmax=5, m = 1.2, dnoise=0.75, method="NC")

# Create noise clustering from random seeds at different levels[从随机种子在不同的层次上创建噪声聚类]
wetland.nc2 = random.vegclust(wetland.chord, cmin=2, cmax=5, nstart=10, m = 1.2, dnoise=0.75, method="NC")

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