clustconst(vegclust)
clustconst()所属R语言包：vegclust
Constancy table of a classification
恒常的分类表
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Allows studying the constancy table (i.e. the frequency of species in each class) of a classification represented in the form of a membership data matrix.
允许研究恒常表（即在每个类中的物种的频率）的一个成员资格数据矩阵的形式表示一个分类。
用法----------Usage----------
clustconst(x, memb)
## S3 method for class 'clustconst'
summary(object, mode="all", name=NULL, sort=TRUE, minconst=0.5, digits=3, ...)
参数----------Arguments----------
参数：x
Community data, a site by species data frame.
社区数据，一个网站的物种数据框。
参数：memb
An site-by-group matrix indicating the (hard or fuzzy) membership of each object in x to a set of groups.
网站组矩阵表示（硬或模糊）成员中的每个对象x一套班子。
参数：object
An object of class 'clustconst'.
对象类的clustconst。
参数：mode
Use mode="all" to print the constancy table, mode="cluster" to print constancy values for one cluster, and mode="species", to print constancy values for one species.
使用mode="all"的要打印的恒常表，mode="cluster"打印恒定值，为一个聚类，mode="species"，一个物种打印恒定值。
参数：name
A string with the name of a cluster (in mode="cluster"), or the name of a species (in mode="species").
一个字符串，其中一个聚类的名称（在mode="cluster"），或一个物种（在mode="species"）的名称。
参数：sort
A flag to indicate whether constancy table should be sorted in descending order.
一个标志，指示是否坚贞表应以降序排序。
参数：minconst
A threshold used to limit the values shown.
使用的阈值限制值。
参数：digits
The number of digits for rounding.
数为四舍五入的位数。
参数：...
Additional parameters for summary (actually not used).
简易的附加参数（实际未使用）。
Details
详细信息----------Details----------
The constancy value of a species in a vegetation unit is the relative frequency of occurrence of the species in plot records that belong to the unit. In case of a fuzzy vegetation unit the constancy value is the sum of memberships of sites that contain the species divided by the sum of memberships of all sites. Use the 'summary' function to obtain information about: (1) which species are more frequent on a given vegetation unit; (2) which vegetation units have higher frequencies of a given target species. Additionally, the 'summary' function can sort a constancy table if mode="all" and sort=TRUE are indicated.
一个物种的植被单元的恒定值，是属于该单位在图记录的物种发生的相对频率。在的模糊植被单元的情况下，恒定值的总和的网站包含的物种的总和除以所有网站的会员资格的会员资格。使用“摘要”功能，以获取有关：（1）更频繁地在给定的植被单位;（2）植被单位有更高的频率给定的目标物种的物种。此外，如果mode="all"和sort=TRUE表示，“摘要”功能，可以按一个恒定表。
值----------Value----------
Function clustconst returns an object of type 'clustconst', in fact a data frame with the constancy value of each species (rows) on each cluster (column).
函数clustconst返回一个对象类型的clustconst“的，其实每个物种的恒定值（行）的数据框在每个聚类（列）。
（作者）----------Author(s)----------
Miquel De C谩ceres, Forest Science Center of Catalonia
参见----------See Also----------
vegclust, kmeans
vegclust，kmeans
实例----------Examples----------
# Loads stats[负载统计]
library(stats)
# Loads data [数据加载]
data(wetland)
# This equals the chord transformation (see also 'normalize' option in \code{\link{decostand}} from the vegan package)[这等于和弦转换（参见标准化选项\ {\的链接{decostand}}从素食包的代码）]
wetland.chord = as.data.frame(sweep(as.matrix(wetland), 1, sqrt(rowSums(as.matrix(wetland)^2)), "/"))
# Performs a K-means clustering[执行K-means聚类]
wetland.km = kmeans(wetland.chord, centers=3, nstart=10)
# Gets constancy table of KM (i.e. hard) clusters[KM（即硬盘）聚类取得坚贞表]
c=clustconst(wetland.chord, memb=as.memb(wetland.km$cluster))
#Prints constancy values ordered and store the result in d[订购打印恒定值，并将结果存储在d]
d=summary(c, mode="all")
#Prints the most frequent species in the first cluster[打印的第一簇中的最频繁的物种]
summary(c, mode="cluster", name=names(c)[1])
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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-10-1 15:15:54
