orditorp(vegan)
orditorp()所属R语言包：vegan
Add Text or Points to Ordination Plots
添加文字或积分排序图
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function adds text or points to ordination plots. Text will be used if this can be done without overwriting other text labels, and points will be used otherwise. The function can help in reducing clutter in ordination graphics, but manual editing may still be necessary.
该函数将text或points，以协调图。文本将被使用，如果可以做到这一点，而不会覆盖其他文字标签，并指出，否则将使用。该功能可以帮助协调图形中的混乱程度在降低，但手动编辑可能仍然是必要的。
用法----------Usage----------
orditorp(x, display, labels, choices = c(1, 2), priority,
cex = 0.7, pcex, col = par("col"), pcol,
pch = par("pch"), air = 1, ...)
参数----------Arguments----------
参数：x
A result object from ordination or an ordiplot result.
协调的一个结果对象或ordiplot的结果。
参数：display
Items to be displayed in the plot. Only one alternative is allowed. Typically this is "sites" or "species".
在图中显示的项目。只有一个选择是允许的。通常，这是"sites"或"species"。
参数：labels
Optional text used for labels. Row names will be used if this is missing.
用于可选的文本标签。如果没有这个，将使用行名称。
参数：choices
Axes shown.
轴所示。
参数：priority
Text will be used for items with higher priority if labels overlap. This should be vector of the same length as the number of items plotted.
文本将被用于具有较高优先级的项目，如果标签重叠。这应该是相同的长度的矢量，作为绘制的项目数。
参数：cex, pcex
Text and point sizes, see plot.default..
文字和点的大小，请参阅plot.default..
参数：col, pcol
Text and point colours, see plot.default.
文本和点的颜色，看到plot.default。
参数：pch
Plotting character, see points.
绘制字符，请参阅points。
参数：air
Amount of empty space between text labels. Values <1 allow overlapping text.
文本标签之间的空间量。值<1，允许重叠文本。
参数：...
Other arguments to scores (and its various methods), text and points.
其他参数scores（和它的各种方法），text和points。
Details
详细信息----------Details----------
Function orditorp will add either text or points to an existing plot. The items with high priority will be added first and text will be used if this can be done without overwriting previous labels,and points will be used otherwise. If priority is missing, labels will be added from the outskirts to the centre. Function orditorp can be used with most ordination results, or plotting results from ordiplot or ordination plot functions (plot.cca, plot.decorana, plot.metaMDS).
功能orditorp添加文字或点到现有的图。高priority的项目将被添加第一和text将使用，如果可以做到这一点，而不会覆盖前面的标签，和points，否则将被用于。如果priority丢失，标签将被添加从郊区到中心。功能orditorp可以用最协调的结果，或绘制结果ordiplot或协调绘图功能的（plot.cca，plot.decorana，plot.metaMDS“）。
Arguments can be passed to the relevant scores method for the ordination object (x) being drawn. See the relevant scores help page for arguments that can be used.
参数可以传递给相关scores方法的协调对象（x）正在绘制。请参阅相关scores帮助页面，可以使用的参数。
值----------Value----------
The function returns invisibly a logical vector where TRUE means that item was labelled with text and FALSE means that it was marked with a point. The returned vector can be used as the select argument in ordination text and points functions.
不可见的，该函数返回一个逻辑向量TRUE是指该项目被标记的文本和FALSE是指它被打上一个点。协调select和text函数返回的向量可作为points参数。
（作者）----------Author(s)----------
Jari Oksanen
实例----------Examples----------
## A cluttered ordination plot :[＃A杂乱的排序图：]
data(BCI)
mod <- cca(BCI)
plot(mod, dis="sp", type="t")
# Now with orditorp and abbreviated species names[现在与orditorp和物种名称缩写]
cnam <- make.cepnames(names(BCI))
plot(mod, dis="sp", type="n")
stems <- colSums(BCI)
orditorp(mod, "sp", label = cnam, priority=stems, pch="+", pcol="grey")
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发表于 2012-10-1 15:10:29
