R语言 vegan包 MDSrotate()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

MDSrotate(vegan)
MDSrotate()所属R语言包：vegan

                                         Rotate First MDS Dimension Parallel to an External Variable
                                         旋转首先的MDS尺寸平行于外部变量

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function rotates a multidimensional scaling result so that its first dimension is parallel to an external (environmental variable). The function can handle the results from
功能旋转多维标度的结果，因此它的第一个维度是平行于外部（环境变量）。该功能可以处理的结果


用法----------Usage----------


MDSrotate(object, vec, na.rm = FALSE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
A result object from metaMDS or monoMDS.
一个结果对象从metaMDS或monoMDS。


参数：vec
A continuous environmental variable (vector of the same length as the number of points).
一种连续的环境变量（矢量的相同的长度的点的数量）。


参数：na.rm
Remove missing values from the continuous variable vec.
删除缺失值的连续变量vec。


参数：...
Other arguments (ignored).  
其他参数（忽略）。


Details

详细信息----------Details----------

The orientation and rotation are undefined in multidimensional scaling.  Functions metaMDS and metaMDS can rotate their solutions to principal components so that the dispersion of the points is highest on the first dimension. Sometimes a different rotation is more intuitive, and MDSrotate allows rotation of the result so that the first axis is parallel to a given external variable.  
在多维尺度是不明确的方向和旋转。功能metaMDS和metaMDS可以旋转，他们的解决方案的主要组件，使分散的点，第一个维度是最高的。有时，一个不同的旋转更直观，和MDSrotate允许的旋转的结果，使得第一轴是平行于给定的外部变量。


值----------Value----------

Function returns the original ordination result, but with rotated scores (both site and species if available), and the pc attribute of scores set to FALSE.  
函数返回原协调的结果，但与旋转的分数（包括网站和物种如果有的话），和pc属性设置为FALSE的分数。


（作者）----------Author(s)----------



Jari Oksanen




参见----------See Also----------

metaMDS, monoMDS.
metaMDS，monoMDS。


实例----------Examples----------


data(varespec)
data(varechem)
mod <- monoMDS(vegdist(varespec))
mod <- with(varechem, MDSrotate(mod, pH))
plot(mod)
ef <- envfit(mod ~ pH, varechem, permutations = 0)
plot(ef)
ordisurf(mod ~ pH, varechem, knots = 1, add = TRUE)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。