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R语言 cellHTS包 ROC()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 14:22:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
ROC(cellHTS)
ROC()所属R语言包:cellHTS

                                        Creates an object of class "ROC" which can be plotted as a ROC curve
                                         创建一个类的“中华民国”,它可以作为一个ROC曲线绘制的对象

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function ROC construct an object of S3 class ROC, which represents a receiver-operator-characteristic curve, from the data of the annotated positive and negative controls in a scored cellHTS object.
函数ROCS3类ROC,它代表一个接收操作特性曲线,从1拿下cellHTS对象的正面和负面的注解控制的数据,构造一个对象。


用法----------Usage----------


ROC(x, positives, negatives)
## S3 method for class 'ROC'
plot(x, col="darkblue", type="l", main = "ROC curve", ...)
## S3 method for class 'ROC'
lines(x, ...)



参数----------Arguments----------

参数:x
a cellHTS object that has already been scored (see details).
cellHTS对象,已经取得了(见详情)。


参数:positives
a list or vector of regular expressions specifying the name of the positive controls.  See the details for the argument posControls of writeReport function.
正则表达式指定的阳性对照的名称列表或向量。看到参数细节posControlswriteReport功能。“


参数:negatives
a vector of regular expressions specifying the name of the negative controls.  See the details for the argument negControls of writeReport function.
一个正则表达式的向量指定名称的阴性对照。看到参数细节negControlswriteReport功能。“


参数:col
the graphical parameter for color; see par for details.
彩色图形参数;par详情。


参数:type
the graphical parameter giving the type of plot desired; see par for details.
提供所需的图类型的图形参数;par详情。


参数:main
the graphical parameter giving the desired title of plot; see par for details.
图给予所需的标题图形参数;par详情。


参数:...
other graphical parameters as in par may be also passed as arguments.
par其他图形参数也可以作为参数传递。


Details

详情----------Details----------

The cellHTS object x must contain a slot called score, and selection proceeds from large to small values of this score. Furthermore, x is expected to contain positive and negative controls annotated in the slot wellAnno with the values of the arguments positives and negatives, respectively. If the assay is a two-way experiment, positives should be a list with components act
cellHTS对象x必须包含插槽称为score,从大到小值这个分数选择的收益。此外,x预计包含正面和负面在插槽wellAnno的参数值positives和negatives,分别控制注明。如果检测是双向的实验中,positives应该与组件act列表


值----------Value----------

An S3 object of class ROC. There are methods
S3对象的类ROC。有方法


作者(S)----------Author(s)----------


Ligia P. Bras <a href="mailto:ligia@ebi.ac.uk">ligia@ebi.ac.uk</a>



举例----------Examples----------


    data(KcViabSmall)
    ## Not run: [#无法运行:]
    x <- normalizePlates(KcViabSmall, normalizationMethod="median", zscore="-")
    x <- summarizeReplicates(x)
    y <- ROC(x)
    plot(y)
    lines(y)
   
## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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