logkda(untb)
logkda()所属R语言包：untb
Etienne's K(D,A)
Etienne的K（D，A）
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Calculates Etienne's K(D,A) using a variety of different methods
计算Etienne的K(D,A)使用各种不同的方法
用法----------Usage----------
logkda.R(a, use.brob=TRUE)
logkda.a11(a)
logkda.pari(a, numerical=TRUE)
logkda.polyn(a)
logkda(a, method="pari", ...)
参数----------Arguments----------
参数：a
Count object
Count对象
参数：use.brob
In function logkda.R(), Boolean, with default TRUE meaning to use Brobdingnagian numbers for the calculation. This is slower but allows one to analyze larger datasets
在功能logkda.R()，布尔值，默认TRUE的这意味着使用Brobdingnagian数字的计算。这是速度较慢，但允许一个更大的数据集进行分析
参数：numerical
In function logkda.pari(), Boolean, with default TRUE meaning to return a numerical vector and FALSE meaning to return the string produced by pari/gp
在功能logkda.pari()，布尔值，默认TRUE的这意味着返回一个数值向量和FALSE的这意味着返回生成的字符串pari/gp
参数：method
In function logkda(), a string specifying which method to use. Takes “R”, “a11”, or “pari”
在功能logkda()，一个字符串，指定要使用的方法。以“R”，“A11”，或“同等”
参数：...
In function logkda(), further arguments which are passed to the other functions
在功能logkda()，进一步的参数，这些参数传递给其他的功能
Details
详细信息----------Details----------
The user should use function logkda(), which is a wrapper for the other functions. Note that the default method, pari, requires the pari/gp system to be installed. This is the preferred option because it is much faster than the other methods.
用户应使用功能logkda()，这是一个包装的其他功能。请注意，默认的方法，pari，需要PARI / GP要安装的系统。这是最佳的选择，因为它比其他方法要快得多。
Functions logkda.R() and logkda.pari() calculate K(D,A) using the method appearing in Etienne (2005), supplementary online material; they use R and pari/gp respectively. Function logkda.a11 is a direct implementation of formula A11 in Etienne (2005). The formula is
功能logkda.R()和logkda.pari()算K(D,A)使用的方法中出现的艾蒂安（2005年），补充在线材料，他们使用R和pari/gp分别。函数logkda.a11是直接执行公式A11艾蒂安（2005）。其计算公式为
where \overline{s}≤ft(n_i,a_i\right) are Stirling numbers of the first kind (see logS1).
\overline{s}≤ft(n_i,a_i\right)是第一类Stirling数（见logS1）。
注意----------Note----------
If method takes its default value of “pari”, and pari/gp is not installed (the test is gp --version), then the method is changed to R and a warning given.
如果method它的默认值“pari”，和pari/gp不安装（测试gp --version），则该方法更改为<X >，并给予警告。
Function logkda.a11() is included because the computational method is a direct transcription of formula A11; it is very slow.
函数logkda.a11()包括在内，因为计算方法是直接转录式A11，这是非常缓慢的。
Function logkda.pari() is a wrapper for .logkda.pari.windows() or .logkda.pari.unix(). It uses “if(R.Version()$os == 'windows')” to check for windows operating systems.
功能logkda.pari()是的包装.logkda.pari.windows()或.logkda.pari.unix()。它使用“if(R.Version()$os == 'windows')”检查的windows操作系统。
It would be nice to use gp2c (rather than gp) but I can't make the “-g” flag work properly; and I had to hack gp2c-run to make it call gp with the -q flag
这将是很好用gp2c（而不是gp），但我不能让“-g”标志工作正常;，我不得不砍gp2c-run使其调用gp与-q标志
（作者）----------Author(s)----------
Robin K. S. Hankin; <code>logkda()</code> is an <font face="Courier New,Courier" color="#666666"><b>R</b></font> transliteration of
<code>pari/gp</code> code appearing in Etienne 2005 (supplementary online
material) due to Chave.
Function <code>logkda.polyn()</code> provided by Francois Munoz.
Function <code>.logkda.pari.windows()</code> provided by Andrea Manica and
Francois Munoz.
参考文献----------References----------
Biodiversity”. Ecology Letters, volume 8, pp253–260. <code>doi: 10.111/j.1461-0248.2004.00717.x</code>
2000. “User's guide to PARI/GP”. http://www.parigp-home.de/
参见----------See Also----------
etienne,logS1
etienne，logS1
实例----------Examples----------
a <- count(c(dogs=7,pigs=3,crabs=1,hogs=1,slugs=1))
## Not run: logkda(a)[＃不运行：logkda（一）]
logkda.R(a)
logkda.R(a, use.brob=FALSE)
logkda.a11(a)
# All four should be the same up to numerical errors[所有四个应该是相同的数值误差最多]
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-10-1 13:30:37
