gseaModule(cellHTS2)
gseaModule()所属R语言包：cellHTS2
Constructor for an object of class gseaModule
构造为一个类gseaModule的对象
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
gseaModule objects encapsulate all the information that is necessary to add the results of a gene set enrichment analysis to a cellHTS report. This feature is still experimental
gseaModule对象封装了所有的信息是需要添加一个基因组富集分析结果到cellHTS报告。此功能仍处于试验阶段
用法----------Usage----------
gseaModule(geneSets, statFuns, scores, annotation)
参数----------Arguments----------
参数：geneSets
An object of class GeneSetCollection containing the information about gene sets for which to perform the analysis.
一个类的对象GeneSetCollection包含执行分析有关基因组信息。
参数：statFuns
A list of functions to compute per gene set statistics. These will be called by applyByCategory and need to be able to handle two mandatory arguments: x are the scores for the respective category, and y are all scores of the whole assay. This allows for statistics like t.test(x,y).
一个函数来计算每个基因组的统计列表。这些被称为applyByCategory需要能够处理两个强制参数：x各自类别的分数，y是整个实验的所有分数。这使得像t.test(x,y)统计。
参数：scores
An optional numeric vector of assay scores. This should be extended to also handle numeric matrices for multi-channel assays.
一个可选的数字矢量检测分数。这应延伸到同时处理多通道检测的数字矩阵。
参数：annotation
A data.frame with additional annotation for the repsective gene sets.
一个data.frame的repsective基因组额外的注释。
Details
详情----------Details----------
The resulting gseaModule object can be supplied as an additional argument to writeReport.
可以提供一个额外的参数writeReport产生gseaModule对象。
This feature is still experimental.
此功能仍处于实验阶段。
值----------Value----------
An object of class gseaModule.
对象类gseaModule。
作者（S）----------Author(s)----------
Florian Hahne
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-25 14:16:33
