R语言 cellHTS2包 configurationAsScreenPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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configurationAsScreenPlot(cellHTS2)
configurationAsScreenPlot()所属R语言包：cellHTS2

                                        Screen plot of the plate configuration of a cellHTS object
                                         屏幕积盘配置一个cellHTS对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Screen plot displaying the plate configuration of a cellHTS object.
屏幕显示板cellHTS对象配置的图。


用法----------Usage----------


configurationAsScreenPlot(x, verbose=interactive(), posControls,
negControls, legend=FALSE, main="")



参数----------Arguments----------

参数：x
a configured cellHTS object (i.e. state(x)['configured'] must be TRUE).
配置的cellHTS对象（即state(x)['configured']必须TRUE）。


参数：verbose
a logical value, if TRUE, the function reports some of its intermediate progress. The default is interactive().
一个逻辑值，如果TRUE，功能及其中间体的进展报告。默认interactive()。


参数：posControls
a list or vector of regular expressions specifying the name of the positive controls. See details.
正则表达式指定的阳性对照的名称列表或向量。查看详情。


参数：negControls
a vector of regular expressions specifying the name of the negative controls. See details.
一个正则表达式的向量指定名称的阴性对照。查看详情。


参数：legend
logical defining whether to include a legend.
逻辑的定义是否包括一个传奇。


参数：main
character giving a figure caption.
字符赋予一个数字的标题。


Details

详情----------Details----------

This function calls the function plotScreen to create a screen plot showing the plate configuration (as defined by the plate configuration file used to configure the cellHTS object – see function configure) used for the RNAi experiment stored in x.
此函数调用的功能plotScreen创建一个屏幕图显示板的配置（定义板的配置文件，用于配置cellHTS对象 - 看到configure）所用的功能RNAi实验存储在x。

posControls and negControls should be given as vectors of regular expression patterns specifying the name(s) of the positive(s) and negative(s) controls, respectivey, as provided in the plate configuration file  (and acccessed via wellAnno(x)).
posControls和negControls应指定名称（S）（S）（S）的积极和消极的控制，respectivey板配置文件的规定，（正则表达式模式的向量acccessed通过wellAnno(x)）。

By default, if posControls is not given, "pos" will be taken as the annotation name for the wells containing positive controls. Similarly, if negControls is missing, by default "neg" will be considered as the name used to annotate the negative controls.  The content of posControls and negControls will be passed to regexpr for pattern matching within the well annotation given in column controlStatus of the featureData slot of the cellHTS object.  
默认情况下，如果posControls没有给出，“POS”将被视为注释包含阳性对照井的名字。同样，如果negControls缺少，默认情况下，“南德”将被视为阴性对照用来注释的名称。 posControls和negControls将传递给regexpr以及注释内的匹配模式在列给controlStatusfeatureData插槽的<内容X>对象。


值----------Value----------

Invisibly, a vector with the color map used to display the well annotation in the image plot.
无形中，用于显示图像中的图以及注释的彩色图的向量。


作者（S）----------Author(s)----------


Ligia Bras <a href="mailto:ligia@ebi.ac.uk">ligia@ebi.ac.uk</a>



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

plotScreen, writeReport
plotScreen，writeReport


举例----------Examples----------


    data("KcViab")
    configurationAsScreenPlot(KcViab)

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注：
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