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LinearMResult-class(Category)
LinearMResult-class()所属R语言包：Category

                                        Class "LinearMResult"
                                         类“LinearMResult”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class represents the results of a test for systematic change in some gene-level statistic by gene sets.  The linearMTest generic function returns an instance of the LinearMResult class.
这个类代表了测试系统的变化，在一些基因组的基因水平的统计结果。 linearMTest泛型函数返回一个LinearMResult类的实例。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("LinearMResult",     ...), but is more commonly created using a call to linearMTest.
可以通过检测的形式new("LinearMResult",     ...)创建对象，但更常用的创建调用linearMTest使用。


插槽----------Slots----------




pvalues: Object of class "numeric", with the p-values for each term.
pvalues：Object类的"numeric"，每届任期为p值。




pvalue.order: Object of class "integer", the order vector (increasing) for the p-values.
pvalue.order：Object类的"integer"，为了向量为P-值（增加）。




effectSize: Object of class "numeric", with the effect size for each term.
effectSize：对象类"numeric"，每学期的规模效应。




annotation: Object of class "character" ~~
annotation：Object类的"character"~~




geneIds: Object of class "ANY" ~~
geneIds：Object类的"ANY"~~




testName: Object of class "character" ~~
testName：Object类的"character"~~




pvalueCutoff: Object of class "numeric" ~~
pvalueCutoff：Object类的"numeric"~~




minSize: Object of class "integer" ~~
minSize：Object类的"integer"~~




testDirection: Object of class "character" ~~
testDirection：Object类的"character"~~




conditional: Object of class "logical" ~~
conditional：Object类的"logical"~~




graph: Object of class "graph" ~~
graph：Object类的"graph"~~




gsc: Object of class "GeneSetCollection" ~~
gsc：Object类的"GeneSetCollection"~~


延伸----------Extends----------

Class "LinearMResultBase", directly.
类"LinearMResultBase"，直接。


方法----------Methods----------




effectSize signature(r = "LinearMResult"): ...
effectSizesignature(r = "LinearMResult")...




geneIdUniverse signature(r = "LinearMResult"): ...
geneIdUniversesignature(r = "LinearMResult")...




pvalues signature(r = "LinearMResult"): ...
pvaluessignature(r = "LinearMResult")...


作者（S）----------Author(s)----------


Deepayan Sarkar, Michael Lawrence



参见----------See Also----------

linearMTest
linearMTest


举例----------Examples----------


showClass("LinearMResult")

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注：
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