R语言 Category包 ChrMapHyperGResult-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

ChrMapHyperGResult-class(Category)
ChrMapHyperGResult-class()所属R语言包：Category

                                        Class "ChrMapHyperGResult"
                                         类“ChrMapHyperGResult”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class represents the results of a Hypergeometric test for over-representation of genes in a selected gene list in the chromosome band annotation.  The hyperGTest function returns an instance of ChrMapHyperGResult when given a parameter object of class ChrMapHyperGParams.  For details on accessing the results, see HyperGResult-accessors.
这个类表示一个基因表示，在选定的基因在染色体带注释列表的超几何测试的结果。 hyperGTest函数返回实例ChrMapHyperGResult一类的参数对象时ChrMapHyperGParams。有关访问结果的详细信息，请参阅HyperGResult的存取。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("ChrMapHyperGResult", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("ChrMapHyperGResult", ...)。


插槽----------Slots----------




pvalue.order: Object of class "integer" that
pvalue.order：Object类的"integer"，




conditional: Object of class "logical" is a flag indicating whether or not this result is from a
conditional："logical"类的对象是一个标志，指示是否这个结果是从




chrGraph: Object of class "graph".  The nodes are the chromosome bands with edges representing the tree structure of the bands.  Each node has a "geneIds"
chrGraph类"graph"的对象。代表乐队的树结构的边缘节点的染色体带。每个节点都有"geneIds"




annotation: A string giving the name of the chip
annotation：一个字符串，给出了芯片的名称




geneIds: Object of class "ANY": the input vector of gene identifiers intersected with the universe of gene identifiers used in the computation.  The class of this slot is specified as "ANY" because gene IDs may be integer or
geneIds：Object类的"ANY"：在计算中使用的基因标识的宇宙相交的基因标识的输入向量。这个槽类被指定为"ANY"因为基因标识，可能是整数或




testName: A string identifying the testing method
testName：一个字符串，确定测试方法




pvalueCutoff: Numeric value used a a p-value cutoff.  Used by the show method to count number of significant terms.
pvalueCutoff：数值用一个p值截止。 show方法用于计算的若干重要方面。




testDirection: Object of class "character" indicating whether the test was for over-representation
testDirection"character"测试是否是过度代表：类对象


延伸----------Extends----------

Class "HyperGResultBase", directly.
类"HyperGResultBase"，直接。


方法----------Methods----------

See HyperGResult-accessors.
HyperGResult的存取。


作者（S）----------Author(s)----------


Seth Falcon



举例----------Examples----------


showClass("ChrMapHyperGResult")
## For details on accessing the results:[＃访问结果的详细信息：]
##     help("HyperGResult-accessors")[＃帮助（“HyperGResult，存取”）]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。