R语言 CAMERA包 psDist-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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psDist-methods(CAMERA)
psDist-methods()所属R语言包：CAMERA

                                        Distance methods for xsAnnotate
                                         xsAnnotate距离方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The package xcms contains several methods for calculating a distance between two sets of peaks. the CAMERA method psDist is the generic wrapper to use these methods for processing two pseudospectra from two different xsAnnotate objects.
在的包xcms包含两套峰之间的距离计算的几种方法。摄像机的方法psDist是通用的包装，使用这些方法处理从两个两个不同xsAnnotate对象伪谱。


参数----------Arguments----------

参数：object1
a xsAnnotate object with pseudospectra
xsAnnotate对象与伪谱


参数：object2
a xsAnnotate object with pseudospectra
xsAnnotate对象与伪谱


参数：PSpec1
index of pseudospectrum in object1
伪谱指数在object1


参数：PSpec2
index of pseudospectrum in object2
在Object2的伪谱指数


参数：method
method to use for distance calculation. See details.
使用距离计算方法。查看详情。


参数：...
mzabs, mzppm and parameters for the distance function.
mzabs，mzppm和距离函数的参数。


Details

详情----------Details----------

Different algorithms can be used by specifying them with the method argument. For example to use the "meanMZmatch" approach one would use: specDist(object1, object2, pspectrum1, pspectrum2, method="meanMZmatch"). This is also the default.
由他们指定method参数，可以使用不同的算法。例如使用“meanMZmatch”的人会使用的方法：specDist(object1, object2, pspectrum1, pspectrum2, method="meanMZmatch")。这也是默认的。

Further arguments given by ... are passed through to the function implementing the method.
由...进一步参数通过执行method的功能。

A character vector of nicknames for all the  algorithms which are available is returned by  getOption("BioC")$xcms$specDist.methods. If the nickname of a method is called "meanMZmatch", the help page for that specific method can be accessed with ?specDist.meanMZmatch.
返回getOption("BioC")$xcms$specDist.methods的绰号为所有可用的算法的一个特征向量。如果一个方法的外号叫“meanMZmatch”，具体方法，帮助页面，可以用?specDist.meanMZmatch访问。


值----------Value----------


参数：mzabs
maximum absolute deviation for two matching peaks  
两个匹配峰的最大绝对偏差


参数：mzppm
relative deviations in ppm for two matching peaks  
在PPM的两个匹配峰的相对偏差


参数：symmetric
use symmetric pairwise m/z-matches only, or each match  
使用对称成对M / Z-匹配，或每场比赛


方法----------Methods----------

                specDist(object1, object2, pspectrum1, pspectrum2,  method,...)                
                specDist(object1, object2, pspectrum1, pspectrum2,  method,...)                


作者（S）----------Author(s)----------


Joachim Kutzera, <a href="mailto:jkutzer@ipb-halle.de">jkutzer@ipb-halle.de</a>

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