TwoSide.varyEffect(TrialSize)
TwoSide.varyEffect()所属R语言包:TrialSize
Two-Sided Tests with varying effect sizes
双侧检验不同的影响大小
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Two-sided tests
双面测试
H0: delta_j = 0
H0:delta_j = 0
Ha: delta_j is not equal to 0
下:delta_j是不等于0的
用法----------Usage----------
TwoSide.varyEffect(s1, s2, m, m1, delta, a1, r1, fdr)
参数----------Arguments----------
参数:s1
We use bisection method to find the sample size, which let the equation h(n)=0. Here s1 and s2 are the initial value, 0<s1<s2. h(s1) should be smaller than 0.
我们用二分法,找到样本大小,这让方程H(N)= 0。这里s1和s2是初始值,0 <S1 <S2。小时(s1)的应该是小于0。
参数:s2
s2 is also the initial value, which is larger than s1 and h(s2) should be larger than 0.
s2是也大于s1和小时(s2)中应该是大于0的初始值,它是。
参数:m
m is the total number of multiple tests
m是总数的多个测试
参数:m1
m1 = m - m0. m0 is the number of tests which the null hypotheses are true ; m1 is the number of tests which the alternative hypotheses are true. (or m1 is the number of prognostic genes)
M1 = M - M0。 m0是测试的虚无假设是真实的;货币供应量M1是多少替代的假设是真实的测试。 (或M1预后基因的数量)
参数:delta
delta_j is the varying effect size for jth test. delta_j=(E(Xj)-E(Yj))/sigma_j. Xij(Yij) denote the expression level of gene j for subject i in group 1( and group 2, respectively) with common variance sigma_j^2. We assume delta_j=0, j in M0 and delta_j >0, j in M1=effect size for prognostic genes.
delta_j是第j个测试不同的效果的大小。 ,delta_j(XJ)=(E-E(YJ))/ sigma_j。 XIJ(Yij)的主题,我在第1组(2组),分别表示基因j的表达水平与常见的变异sigma_j ^ 2。我们假设delta_j = 0,J在M0和delta_j> 0,M1 = j的效果大小预后基因。
参数:a1
a1 is the allocation proportion for group 1. a2=1-a1.
A1是第1组的分配比例。 a2表示1-α1。
参数:r1
r1 is the number of true rejection
r1是真正的排斥反应的数目
参数:fdr
fdr is the FDR level.
纪录器FDR级。
Details
详细信息----------Details----------
alpha_star=r1*fdr/((m-m1)*(1-fdr)), which is the marginal type I error level for r1 true rejection with the FDR controlled at f.
alpha_star = R1 * FDR /((M-M1)*(1-FDR)),这是边缘型I误差控制在f R1真正拒绝与FDR水平。
beta_star=1-r1/m1, which is equal to 1-power.
beta_star = 1-r1/m1,这是等于1功率。
参考文献----------References----------
实例----------Examples----------
Example.12.2.4<-TwoSide.varyEffect(s1=100,s2=200,m=4000,m1=40,delta=c(rep(1,40/2),rep(1/2,40/2)),a1=0.5,r1=24,fdr=0.01)
Example.12.2.4
# n=164 s1<n<s2, h(s1)<0,h(s2)<0[Ň= 164 S1 <N <s2的,小时(s1)的<0,小时(s2)中<0]
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