R语言 CAMERA包 getpspectra()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getpspectra(CAMERA)
getpspectra()所属R语言包：CAMERA

                                        Retrieve a peaklist of one or more pseudospectra
                                         检索peaklist一个或多个伪谱

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extract group(s) from a xsAnnotate object. Returns a peaklist as matrix with annotated peaks.
从xsAnnotate对象提取组（S组）。返回作为与注释峰矩阵peaklist。


用法----------Usage----------


  getpspectra(object, grp)



参数----------Arguments----------

参数：object
xsAnnotate object
xsAnnotate对象


参数：grp
index of pseudo-spectra-group
伪谱组指数


Details

详情----------Details----------

xsAnnotate groups LC/MS Peaklist after there EIC correlation and FWHM. These function extract one or more of these so called "pseudo spectra groups" with include the peaklist with there annotations. The annotation depends on a before called findAdducts() ( and findIsotopes() ). Important: The indices for the isotopes, are those from the whole peaklist. See getPeaklist().
LC /质谱Peaklist的xsAnnotate组后，有三电的相关性和半高宽。这些功能提取一个或多个这些所谓的“伪光谱组”包括peaklist有注释。注释取决于前findAdducts（）（findIsotopes（））。重要的是：同位素的指数，是从整个peaklist。看到getPeaklist()。


作者（S）----------Author(s)----------


Carsten Kuhl <ckuhl@ipb-halle.de>



举例----------Examples----------


  library(CAMERA)
  file <- system.file('mzdata/MM14.mzdata', package = "CAMERA")
  xs   <- xcmsSet(c(file), method="centWave", ppm=30, peakwidth=c(5,10))
  an   <- xsAnnotate(xs)
  an   <- groupFWHM(an)
  #For one group[为一组]
  peaklist <- getpspectra(an, 1)
  #For two groups[对于两组]
  peaklist <- getpspectra(an, c(1,2))

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