getPeaklist(CAMERA)
getPeaklist()所属R语言包:CAMERA
Generate the annotatad peaklist
生成annotatad peaklist“
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Extract all information from an xsAnnotate object. Returns a peaklist with annotated peaks.
提取物从xsAnnotate对象的所有信息。返回与注释峰peaklist。
用法----------Usage----------
getPeaklist(object, intval="into")
参数----------Arguments----------
参数:object
xsAnnotate object
xsAnnotate对象
参数:intval
Choose intensity values. Allowed values are into, maxo, intb
选择强度价值观。允许的值是成,maxo,INTB
Details
详情----------Details----------
This function extract the peaktable from an xsAnnotate object, containing three additional columns (isotopes, adducts, pseudospectrum) with represents the annotation results. For a grouped xcmsSet it returns the grouped peaktable.
此功能提取从xsAnnotate对象的peaktable,包含三个附加列(同位素,加合物,伪谱)代表注释的结果。为分组xcmsSet,返回分组peaktable。
作者(S)----------Author(s)----------
Carsten Kuhl <ckuhl@ipb-halle.de>
举例----------Examples----------
library(CAMERA)
file <- system.file('mzdata/MM14.mzdata', package = "CAMERA")
xs <- xcmsSet(file, method="centWave", ppm=30, peakwidth=c(5,10))
an <- xsAnnotate(xs)
an <- groupFWHM(an)
an <- findIsotopes(an)
an <- findAdducts(an,polarity="positive")
peaklist <- getPeaklist(an)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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