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R语言 CAMERA包 getAllPeakEICs()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 14:04:15 | 显示全部楼层 |阅读模式
getAllPeakEICs(CAMERA)
getAllPeakEICs()所属R语言包:CAMERA

                                        Generate EIC information from raw data
                                         从原始数据生成三电信息

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generate EIC data out of the raw data, according to the peak peaker information.
生成三电数据的原始数据,根据峰的微分电路信息。


用法----------Usage----------


  getAllPeakEICs(object, index)



参数----------Arguments----------

参数:object
The xsAnnotate object
xsAnnotate对象


参数:index
Sample index vector, with the same length as the number of peaks.  Encoding from with sample the peak should be extracted. If all peaks should be generated from the same sample set index = rep(sample index, peak count)
样本指数的向量,与峰的数目相同长度。从峰与样品应当提取的编码。如果所有的峰应产生相同的样本集指数REP(样本指数,峰值计数)


Details

详情----------Details----------

The function extract from the raw data the EIC curves. Therefore all .netcdf, .mzdata etc. files must be acessable. It returns a list with two item.
从原始数据功能的三电曲线的提取物。因此所有。NetCDF的。mzdata等文件必须是acessable的。它返回两个项目的列表。


值----------Value----------

A list with items:
与项目列表:


参数:EIC
EIC Matrix with rows = number of peaks and columns = maxscans. It contains mostly NA values and only in that part, where a peak had been found, the intensity information.  
三电矩阵与行= = maxscans峰和列数。它包含大多是不适用的价值观和仅在该部分,其中已发现一个高峰,强度信息。


参数:scantimes
Scantimes of each sample  
对每个样品scantimes


作者(S)----------Author(s)----------


Carsten Kuhl <ckuhl@ipb-halle.de>



参见----------See Also----------

xsAnnotate-class
xsAnnotate-class


举例----------Examples----------


library(CAMERA)
#Multiple sample [多个样品]
library(faahKO)
xs.grp       <- group(faahko)

#create xsAnnotate object [创建xsAnnotate对象]
xsa          <- xsAnnotate(xs.grp)
#generate pseudospectra[产生伪谱]
xsa.group    <- groupFWHM(xsa)

#calculate correlation[计算相关]
tmp <- getAllPeakEICs(xsa.group,index=rep(1,nrow(xsa.group@groupInfo)))
#extract EIC matrix[提取三电矩阵]
EIC.matrix <- tmp$EIC;

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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