findNeutralLossSpecs(CAMERA)
findNeutralLossSpecs()所属R语言包:CAMERA
Find pseudospectra that contains a specific neutral loss
查找伪谱包含一个特定的中性丢失
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The method searches in every pseudospectra for a distance between two ions matching a provided mass difference. It returns a boolean vector with the length equals to the number of pseudospectra, where a hit is marked with TRUE.
在每两个匹配提供了质量差的离子之间的距离的伪谱方法搜索。它返回一个布尔向量的长度等于伪谱数,命中标记与真。
用法----------Usage----------
findNeutralLossSpecs(object, mzdiff=NULL, mzabs=0, mzppm=10)
参数----------Arguments----------
参数:object
xsAnnotate object
xsAnnotate对象
参数:mzdiff
neutral loss in Dalton
在道尔顿的中性丢失
参数:mzabs
absolut allowed mass difference
绝对不允许质量差
参数:mzppm
relative allowed mass difference
相对允许质量差
Details
详情----------Details----------
The function needs a xsAnnotate object after groupCorr or groupFWHM.
该函数需要一个,后groupCorr或groupFWHM xsAnnotate对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Carsten Kuhl <ckuhl@ipb-halle.de>
举例----------Examples----------
library(CAMERA)
file <- system.file('mzdata/MM14.mzdata', package = "CAMERA")
xs <- xcmsSet(file, method="centWave", ppm=30, peakwidth=c(5,10))
an <- xsAnnotate(xs)
an <- groupFWHM(an)
#Searches for Pseudspecta with water loss[失水Pseudspecta搜索]
hits <- findNeutralLossSpecs(an, mzdiff=18.01, mzabs=0.01)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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