R语言 CALIB包 SpikeList-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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SpikeList-class(CALIB)
SpikeList-class()所属R语言包：CALIB

                                         Class "SpikeList" - Spike Intensity and Concentration List
                                         类“SpikeList” - 穗强度和浓度名单

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A simple list-based class for storing red and green channel foreground and background intensities, spot area and
一个简单的基于列表的红色和绿色通道的前景和背景强度，名胜区，用于存储类


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("SpikeList", spike) where spike is a list. In the CALIB package, SpikeList objects are normally generated by function  read.spike.
对象可以创建检测形式new("SpikeList", spike)其中穗是一个列表。在的CALIB包，通常SpikeList对象所产生的功能read.spike。


列表组件----------List Components----------

Objects should contain the following list components:
对象应包含以下列表中的组件：




R:  numeric matrix containing the red(Cy5) foreground intensities of all external control spikes on arrays. Rows correspond to spikes and
R：含有红色（Cy5的）阵列上的所有外部控制尖峰前景强度的数值矩阵。行对应的尖峰和




G:  numeric matrix containing the green(Cy3) foreground intensities
G：数字矩阵含绿色（Cy3标记）前景强度




Rb:  numeric matrix containing the red(Cy5) background intensities
Rb：数字矩阵含有红色背景强度（Cy5标记）




Gb:  numeric matrix containing the green(Cy3) background intensities
Gb：数字矩阵含绿色（Cy3标记）背景强度




RArea:  numeric matrix containing the red(Cy5) spot areas of all
RArea：数字矩阵含有红色（Cy5的）所有的热点区域




GArea:  numeric matrix containing the green(Cy3) spot areas of all
GArea：数字矩阵含绿色（Cy3标记）所有的热点区域




RConc:  numeric matrix containing the red(Cy5) known concentrations
RConc：数字矩阵含有红色（Cy5的）已知浓度




GConc:  numeric matrix containing the green(Cy3) know concentrations
GConc：数字矩阵含绿色（Cy3标记）知道浓度




genes:  data.frame containing information on spikes spotted on the arrays.
genes：在阵列上发现的尖峰数据框包含的信息。

All of the matrices should have the same dimensions.
所有的矩阵应该有相同的尺寸。


延伸----------Extends----------

Class "list", from data part. Class "vector", by class "list".
类"list"，从数据的一部分。类"vector"类"list"。


方法----------Methods----------

This class inherits directly from class List, so any operation appropriate for lists will work on objects of this class. In addition, SpikeList objects can be subsetted, combined and merged. SpikeList objects will return dimensions and hence functions such as dim, dimnames, nrow and ncol are defined. Generic method show is applied on SpikeList, so SpikeList will print in a compact way.
直接从这个类继承类列表，因此列表的适当的任何操作，将这个类的对象。此外，SpikeList对象可以是subsetted，combined和merged。 SpikeList对象将返回尺寸和功能，如dim，dimnames，nrow和ncol定义。通用方法showSpikeList，所以SpikeList将打印在一个紧凑的方式应用。

SpikeList objects are used on functions such as estimateParameter or on some other data visualization functions like plotSpikeHI in the CALIB package.
使用功能，如SpikeList对象的estimateParameter或其他一些数据可视化功能，如plotSpikeHI的CALIB包。


作者（S）----------Author(s)----------


Hui Zhao



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>   <code>RGList_CALIB</code>.

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注：
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