spike(CALIB)
spike()所属R语言包:CALIB
Experiment Data: SpikeList Example
实验数据:SpikeList为例
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This SpikeList object contains all the spikes in dataset
这SpikeList对象包含在数据集中的所有尖峰
RG.It is generated by the function<br> read.spike from RG and user-specified concentraion file in the CALIB package.
RG。它是由生成函数参考read.spike从RG和用户指定的CALIB包concentraion文件。
用法----------Usage----------
data(spike)
格式----------Format----------
spike is an SpikeList object containing the following list components: \$R,\$G,\$Rb,\$Gb,<br>\$RArea,\$GArea,\$RConc,\$GConc and \$genes. It represents two microarrays and 600 spikes, including 480 calibration controls, 96 ratio controls and 24 negative controls.
spike是SpikeList对象,它包含以下列表中的组件:\ $ŕ,\~$ G \ $铷,\ $千兆,参考\ $ RArea,\ $ GArea,\ $ RConc, \ $ GConc和\ $基因。它代表了两个芯片和尖峰600人,其中包括480校准控制,96比控制和24个阴性对照。
源----------Source----------
For the source information, see the introduction of dataset RG.
源信息,引进集RG。
参考文献----------References----------
A calibration method for estimating absolute expression levels from microarray data. Bioinformatics 22: 1251-1258.
Arabidopsis functional genomics: transcript profiling and reverse genetics applications. Genome Res. 14, 2176-2189.
举例----------Examples----------
data(spike)
plotSpikeRG(spike,array=1)
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