disstree2dot(TraMineR)
disstree2dot()所属R语言包:TraMineR
Graphical representation of a dissimilarity tree
图形表示的相异树
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Functions to generate a "dot" file and associated images files that can be used in GraphViz to get a graphical representation of the tree.
函数来产生一个“点”文件和关联的图像文件GraphViz的,可用于在得到一个图形表示的树。
用法----------Usage----------
disstree2dot(tree, filename, digits=3, imagefunc=NULL, imagedata=NULL,
imgLeafOnly=FALSE, devicefunc="jpeg", imageext="jpg",
device.arg=list(), use.title=TRUE, label.loc="main",
node.loc="main", split.loc="sub", title.cex=1, legendtext=NULL,
legendimage=NULL, qualityimage=NULL, showdepth=FALSE, ...)
disstree2dotp(tree, filename, imagedata=NULL, imgLeafOnly=FALSE,
imagefunc=plot, title.cex=3, withquality=TRUE,
quality.fontsize=title.cex, ...)
seqtree2dot(tree, filename, seqdata=tree$info$object, imgLeafOnly=FALSE,
sortv=NULL, dist.matrix=NULL, title.cex=3, withlegend="auto",
legend.fontsize=title.cex, withquality=FALSE,
quality.fontsize=title.cex, axes=FALSE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:tree
The tree to be plotted.
要绘制的树。
参数:filename
A filename, without extension, that will be used to generate image and dot files.
甲不带扩展名的文件名,将被用于生成图像和点文件。
参数:digits
Number of significant digits to plot.
数显着的数字图。
参数:imagefunc
A function to plot the individuals in a node, see details.
一个函数来绘制个人中的一个节点,查看详细信息。
参数:imagedata
a data.frame that will be passed to imagefunc, see details.
一个data.frame将被传递给imagefunc,查看详细信息。
参数:imgLeafOnly
Logical: If TRUE, only terminal node will be plotted.
逻辑:如果TRUE,只有终端节点将被绘制。
参数:devicefunc
A device function, "jpeg" by default.
设备功能,"jpeg"默认情况下。
参数:imageext
extension for image files.
图像文件的扩展名。
参数:device.arg
Argument passed to devicefunc.
参数传递到devicefunc。
参数:use.title
Logical: If TRUE, node information will be printed using title command, see details.
逻辑:如果TRUE,节点信息将被打印使用title命令,查看详细信息。
参数:label.loc
Location of the node label, see title for possible values.
节点标签的位置,请参阅title可能的值。
参数:node.loc
Node content location, see title for possible values.
节点内容的位置,请参阅title可能的值。
参数:split.loc
Split information location, see title for possible values.
分割信息的位置,请参阅title可能的值。
参数:title.cex
cex applied to all calls to title (see use.title).
cex适用于所有来电转接至title(见use.title)。
参数:legendtext
An optional text appearing in a distinct node.
一个可选的文字出现在不同的节点。
参数:legendimage
An optional image file appearing in a distinct node.
一个可选的图像文件中出现在不同的节点上。
参数:qualityimage
An optional image file appearing in a distinct node.
一个可选的图像文件中出现在不同的节点上。
参数:showdepth
Logical. If TRUE, information about depth of the tree is added to the plot.
逻辑。如果TRUE,树的深度信息被添加的图。
参数:withquality
If TRUE, a node displaying fitting measures of the tree is added to the plot.
如果TRUE,显示拟合措施的树节点添加到图。
参数:quality.fontsize
Numeric. Size of the font of the fitting measures node.
数字。配合措施节点的字体大小。
参数:seqdata
a sequence object as defined by the the seqdef function.
一个序列对象所定义的seqdef功能。
参数:sortv
The name of an optional variable used to sort the data before plotting, see seqplot.
用来排序的数据,然后绘制一个可选的变量的名称,请参阅seqplot。
参数:dist.matrix
The name of an optional dissimilarity matrix used to find representative sequences, seqrplot.
使用一个可选的相异度矩阵的名称找到有代表性的序列,seqrplot。
参数:withlegend
defines if and where the legend of the state colors is plotted. The default value "auto" sets the position of the legend automatically. Other possible value is "right". Obsolete value TRUE is equivalent to "auto".
定义和传说中的国家的颜色绘制。默认值"auto"自动设置位置的传说。其他可能的值是"right"。过时的价值TRUE是相当于"auto"。
参数:legend.fontsize
Size of the font of the legend.
大小字体的传说。
参数:axes
if set to "all" (default value) x axes are drawn for each plot in the graphic. If set to "bottom" and group is used, axes are drawn only under the plots located at the bottom of the graphic area. If FALSE, no x axis is drawn.
如果设置为"all"(默认值)x轴绘制图形中的每一个图。如果设置为"bottom"和group使用,轴绘制只有在图位于底部的图形面积。如果FALSE,没有x轴的绘制。
参数:...
other parameters that will be passed to imagefunc or seqplot (for seqtree2dot).
其他参数将被传递到imagefunc或seqplot(为seqtree2dot)。
Details
详细信息----------Details----------
These functions generate a "dot" file that can be used in GraphViz (http://www.graphviz.org). It also generates one image per node through a call to imagefunc passing the selected lines of imagedata if present or otherwise a list of indexes (of individuals belonging to a node). These functions are not intended to be used by end-user. See seqtreedisplay and disstreedisplay for a much simpler way to generate a graphical representation of a tree (seqtree or disstree).
这些函数生成一个“点”的文件,该文件可用于GraphViz的(http://www.graphviz.org)。它也产生一个图像,每个节点通过调用imagefunc通过被选中的行imagedata如果存在或以其他方式索引的列表(个人属于一个节点)。这些函数是不打算要由最终用户使用。见seqtreedisplay和disstreedisplay一个更简单的方法来生成树的图形表示(seqtree或disstree)。
seqtree2dot is a shortcut for sequences objects using the plot function seqplot. For each node, it calls seqplot passing the selected lines of seqdata as argument. You should at least specify the type of the plot to use (i.e. using type="d" for instance, see seqplot for more details).
seqtree2dot是一个快捷的序列对象使用绘图功能seqplot。对于每个节点,它调用seqplot的传递选定行seqdata的参数。你至少应该指定type的图(即使用type="d"例如,见seqplot更多详细信息)。
If use.title is TRUE, imagefunc should take care to leave enough space for the title.
use.title如果是TRUE,imagefunc的标题应该注意留出足够的空间。
disstree2dotp is a simplified interface of disstree2dot which automatically leaves enough space for the title and subtitles. These functions are intended to be generic.
disstree2dotp是一个简化的界面disstree2dot的标题和字幕自动留出足够的空间。这些功能是通用的。
值----------Value----------
Nothing but generates a "dot" and several images files (one per node) in the current working directory (see getwd and setwd).
不过生成一个“点”和几个图像文件(每个节点)在当前工作目录(见getwd和setwd)。
参见----------See Also----------
seqtree and seqtreedisplay, disstree and disstreedisplay.
seqtree和seqtreedisplay,disstree和disstreedisplay。
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