plotNormalizedData(CALIB)
plotNormalizedData()所属R语言包：CALIB
plot estimated absolute levels of two conditions
图估计两个条件的绝对水平
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
plot estimated absolute levels of any two user-specified conditions. The values in the plot are in log scale.
图估计用户指定的任何两个条件的绝对水平。在图的值是在log规模。
用法----------Usage----------
plotNormalizedData(data, condition = c(1, 2), xlab = NULL, ylab = NULL,
main = NULL,xlim = NULL, ylim = NULL, pch = 19,
cex = 0.2,col = "black", diag=TRUE, diagcol="blue",
diaglwd=1.5, ...)
参数----------Arguments----------
参数：data
matrix containing estimated absolute levels. columns are conditons and rows are genes.
矩阵包含估计的绝对水平。列的conditons行基因。
参数：condition
integer vector giving the two conditions to be plotted.
要绘制的两个条件的整数向量。
参数：xlab
a title for the x axis.
X轴的标题。
参数：ylab
a title for the y axis.
为Y轴的标题。
参数：main
an overall title for the plot.
图的总冠军。
参数：xlim
the x limits (min,max) of the plot.
的X限制（最小值，最大值）的图。
参数：ylim
the y limits of the plot.
图的Y限制。
参数：pch
an integer code for one of a set of plotting characters or symbols for the spike data set. Default is 19.
一套绘制尖峰数据集的字符或符号的整数代码。默认值是19。
参数：cex
a numerical value giving the amount by which points should be scaled relative to the default. Default is 0.2.
一个数值，使这点应调整相对于默认的金额。默认值是0.2。
参数：col
the color of the points. Default is black.
点的颜色。默认为黑色。
参数：diag
a logical value. Add diagonal on the plot if it is TRUE. Default is TRUE.
一个逻辑值。添加图的对角线如果是TRUE。默认TRUE。
参数：diagcol
the color of the diagonal. Default is blue.
对角线的颜色。默认为蓝色。
参数：diaglwd
the width of the diagonal. Default is 1.5.
对角宽度。默认值是1.5。
参数：...
other graphical parameters can be used in function plot.
其他图形参数，可以使用在函数plot。
Details
详情----------Details----------
The function polts estimated absolute expression levels of two conditions. It accepts expression levels from the argument 'data', which should have the same data format as the output value of the function normalizeData.
该的功能polts估计两个条件的绝对表达水平。它接受的表达水平，从参数数据，它应该有相同的数据格式，功能normalizeData产值。
The two conditions to be plotted should be specified by the argument condition. The condition should be a numeric vector with length two and it should be subset of condition vector of the design matrix. see function NormalizeData.
要绘制这两个条件的，应当指定参数condition。 condition应该是一个长度为二的数字向量，应该条件的设计矩阵向量的子集。见功能NormalizeData。
see other graphic functions for the other arguments.
看到其他参数其他图形功能。
值----------Value----------
A plot is created on the current graphics device.
当前图形设备上创建一个图。
作者（S）----------Author(s)----------
Hui Zhao
举例----------Examples----------
# load data: normalized data[负载数据：规范化的数据]
data(normdata)
# specify the two conditions to be plotted.[指定要绘制的两个条件。]
cond <- c(1,2)
# use the default values for other parameters.[其他参数使用默认值。]
plotNormalizedData(normdata,condition = cond)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 14:00:57
