plot.TPmsm(TPmsm)
plot.TPmsm()所属R语言包:TPmsm
Plot method for a TPmsm object
图方法的TPmsm对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot method for an object of class 'TPmsm'. It draws the estimated transition probabilities in a basic scatterplot.
图方法的对象类的TPmsm“。在一个基本的散点图得出的估计转移概率。
用法----------Usage----------
plot(x, tr.choice, xlab = "Time", ylab="Transition probability",
col, lty, xlim, ylim, conf.int=FALSE, ci.col, ci.lty,
参数----------Arguments----------
参数:x
An object of class 'TPmsm'.
对象的类的TPmsm“。
参数:tr.choice
Character vector of the form 'c("from to", "from to")' specifying which transitions should be plotted. Default, all the transition probabilities are plotted.
字符向量的形式C(“”,“要”)指定的转换应该被绘制。默认情况下,所有的转移概率曲线。
参数:xlab
x-axis label. Default is "Time".
X轴标签。默认值是“时间”。
参数:ylab
y-axis label. Default is "Transition probability".
y轴的标签。默认值是“过渡的可能性”。
参数:col
Vector of colour. Default is black.
矢量的颜色。默认是黑色的。
参数:lty
Vector of line type. Default is 1:number of transitions.
向量的线路类型。默认值是1:数字的转换。
参数:xlim
Limits of x-axis for the plot.
限制x轴的图。
参数:ylim
Limits of y-axis for the plot.
限制y轴的图。
参数:conf.int
Logical. Whether to display pointwise confidence bands. Default is FALSE.
逻辑。是否显示逐点置信区间。默认值是false。
参数:ci.col
Colour of the confidence bands. Default is col.
颜色的置信区间。默认是col。
参数:ci.lty
Line type of the confidence bands. Default is 3.
置信带线类型。默认值是3。
参数:legend
A logical specifying if a legend should be added.
一个逻辑规定,如果一个传奇。
参数:legend.pos
A vector giving the legend's position. See legend for further details.
一个向量传说中的位置。见legend进一步的细节。
参数:curvlab
A character or expression vector to appear in the legend. Default is the name of the transitions.
出现在传说中的字符或表达向量。默认值是过渡的名称。
参数:legend.bty
Box type for the legend. By default no box is drawn.
箱式的传说。默认情况下,没有框画。
参数:...
Further arguments for plot.
进一步参数图。
值----------Value----------
No value is returned.
无返回值。
(作者)----------Author(s)----------
Artur Agostinho Araujo, Javier Roca-Pardinas and Luis Meira Machado
参见----------See Also----------
plot.default, legend.
plot.default,legend。
实例----------Examples----------
# Create survTP object[survTP对象]
data(bladderTP)
bladderTP_obj <- with(bladderTP, survTP(time1, event1, Stime, event))
# Compute KMW transition probabilities with confidence band[计算的KMW过渡概率的置信带]
TPmsm_obj <- transKMW(object=bladderTP_obj, s=5, t=59, conf=TRUE, conf.level=0.95,
method.boot="basic", method.est=2)
# Plot all the transitions without confidence band[绘制所有的转换没有信心带]
plot(TPmsm_obj, conf.int=FALSE, col=seq_len(5), lty=1)
# Plot all the transitions with confidence band[绘制所有的转换与信心带]
tr.choice <- colnames(TPmsm_obj$est)
par.orig <- par( c("mfrow", "cex") )
par( mfrow=c(2,3) )
for ( i in seq_len( length(tr.choice) ) ) {
plot(TPmsm_obj, tr.choice=tr.choice[i], conf.int=TRUE, legend=FALSE, main=tr.choice[i],
xlab="", ylab="")
}
par(mfrow=c(1, 1), cex=1.2)
title(xlab="Time", ylab="Transition probability", line=3)
par(par.orig)
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