plot.TPCmsm(TPmsm)
plot.TPCmsm()所属R语言包:TPmsm
Plot method for a TPCmsm object
图方法的TPCmsm对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot method for an object of class 'TPCmsm'. It draws the estimated transition probabilities in a basic scatterplot.
图方法的对象类的TPCmsm“。在一个基本的散点图得出的估计转移概率。
用法----------Usage----------
plot(x, plot.type="t", tr.choice, xlab, ylab, col, lty, xlim, ylim,
conf.int=FALSE, ci.col, ci.lty, legend=TRUE, legend.pos, curvlab,
参数----------Arguments----------
参数:x
An object of class 'TPCmsm'.
对象的类的TPCmsm“。
参数:plot.type
A character string specifying the type of plot. If 't' the scatterplot of transition probability versus time is ploted. If 'c' the scatterplot of transition probability versus covariate is ploted.
一个字符串指定类型的图。如果“T”的转移概率随时间变化的散点图ploted。如果C的转移概率与协ploted的散点图。
参数:tr.choice
Character vector of the form 'c("from to", "from to")' specifying which transitions should be plotted. Default, all the transition probabilities are plotted.
字符向量的形式C(“”,“要”)指定的转换应该被绘制。默认情况下,所有的转移概率曲线。
参数:xlab
x-axis label.
X轴标签。
参数:ylab
y-axis label.
y轴的标签。
参数:col
Vector of colour.
矢量的颜色。
参数:lty
Vector of line type. Default is 1:number of transitions.
向量的线路类型。默认值是1:数字的转换。
参数:xlim
Limits of x-axis for the plot.
限制x轴的图。
参数:ylim
Limits of y-axis for the plot.
限制y轴的图。
参数:conf.int
Logical. Whether to display pointwise confidence bands. Default is FALSE.
逻辑。是否显示逐点置信区间。默认值是false。
参数:ci.col
Colour of the confidence bands. Default is col.
颜色的置信区间。默认是col。
参数:ci.lty
Line type of the confidence bands. Default is 3.
置信带线类型。默认值是3。
参数:legend
A logical specifying if a legend should be added.
一个逻辑规定,如果一个传奇。
参数:legend.pos
A vector giving the legend's position. See legend for further details.
一个向量传说中的位置。见legend进一步的细节。
参数:curvlab
A character or expression vector to appear in the legend. Default is the name of the transitions.
出现在传说中的字符或表达向量。默认值是过渡的名称。
参数:legend.bty
Box type for the legend. By default no box is drawn.
箱式的传说。默认情况下,没有框画。
参数:...
Further arguments for plot.
进一步参数图。
值----------Value----------
No value is returned.
无返回值。
(作者)----------Author(s)----------
Artur Agostinho Araujo, Javier Roca-Pardinas and Luis Meira Machado
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
plot.default, legend.
plot.default,legend。
实例----------Examples----------
# Create survTP object[survTP对象]
data(heartTP)
heartTP_obj <- with( heartTP, survTP(time1, event1, Stime, event, age) )
# Compute IPCW conditional transition probabilities with confidence band[IPCW有条件的转移概率计算有信心带]
TPCmsm_obj <- transIPCW(heartTP_obj, s=57, t=310, x=c(0, 15), conf=TRUE, n.boot=1000,
method.boot="percentile", method.est=2)
# Build time plots[建立时间图]
tr.choice <- dimnames(TPCmsm_obj$est)[[3]]
par.orig <- par( c("mfrow", "cex") )
par( mfrow=c(2,3) )
for ( i in seq_len( length(tr.choice) ) ) {
plot(TPCmsm_obj, plot.type="t", tr.choice=tr.choice[i], conf.int=TRUE, legend=TRUE, main=tr.choice[i],
col=seq_len( length(TPCmsm_obj$x) ), lty=1, xlab="", ylab="", curvlab=c("Age = 0", "Age = 15"))
}
par(mfrow=c(1, 1), cex=1.2)
title(xlab="Time", ylab="Transition probability", line=3)
par(par.orig)
# Build covariate plots without colors and without confidence band[建立协的图没有颜色和没有信心带]
plot(TPCmsm_obj, plot.type="c", xlab="Age")
# Build covariate plots with colors and without confidence band[建立协图的颜色和没有信心带]
plot(TPCmsm_obj, plot.type="c", col=seq_len(5), lty=1, xlab="Age")
# Build covariate plots with confidence band[建立协图有信心带]
tr.choice <- dimnames(TPCmsm_obj$est)[[3]]
par.orig <- par( c("mfrow", "cex") )
par( mfrow=c(2,3) )
for ( i in seq_len( length(tr.choice) ) ) {
plot(TPCmsm_obj, plot.type="c", tr.choice=tr.choice[i], conf.int=TRUE, legend=FALSE, main=tr.choice[i],
xlab="", ylab="")
}
par(mfrow=c(1, 1), cex=1.2)
title( xlab="Age", ylab=paste("P(", TPCmsm_obj$s, ", ", TPCmsm_obj$t, " | Age)", sep=""), line=3)
par(par.orig)
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