R语言 TPmsm包 contour.TPCmsm()函数中文帮助文档(中英文对照)

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contour.TPCmsm(TPmsm)
contour.TPCmsm()所属R语言包：TPmsm

                                        Contour method for a TPCmsm object
                                         方法的TPCmsm对象轮廓

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Contour method for an object of class 'TPCmsm'. Creates a contour plot of the transition probabilities.
轮廓法的类的TPCmsm“的对象。创建的等高线图的转移概率。


用法----------Usage----------


contour(x, plot.type="tc", tr.choice, nlevels, levels, xlim, ylim, zlim,



参数----------Arguments----------

参数：x
An object of class 'TPCmsm'.
对象的类的TPCmsm“。


参数：plot.type
A character string specifying the type of plot. If 'tc' the contour with time in the x axis, covariate in the y axis and transition probability in the z axis is drawn. If 'ct' the contour with covariate in the x axis, time in the y axis and transition probability in the z axis is drawn. Defaults to 'tc'.
一个字符串指定类型的图。如果tc的x轴随时间的轮廓，在y轴和z轴的转移概率协变量绘制。如果克拉的轮廓与协变量在x轴，在y轴和z轴的转移概率的时间绘制的。默认为“TC”。


参数：tr.choice
Character vector of the form 'c("from to", "from to")' specifying which transitions should be plotted. Default, all the transition probabilities are plotted.
字符向量的形式C（“”，“要”）指定的转换应该被绘制。默认情况下，所有的转移概率曲线。


参数：nlevels
The number of levels to divide the range of z. Defaults to 20 levels.
的级别数，z的范围内分割。默认为20个级别。


参数：levels
Numeric vector of levels at which to draw contour lines. Defaults to pretty(zlim, nlevels).
数字矢量在要绘制等高线的水平。默认为pretty(zlim, nlevels)的。


参数：xlim
Limits of x-axis for the plot.
限制x轴的图。


参数：ylim
Limits of y-axis for the plot.
限制y轴的图。


参数：zlim
Limits of z-axis for the plot. Defaults to c(0, 1).
限制Z轴的图。默认为c(0, 1)的。


参数：col
Color for the lines drawn. Defaults to grey(0.4).
绘制的线条的颜色。默认为grey(0.4)的。


参数：xlab
x-axis label. If plot.type="tc" defaults to "Time". If plot.type="ct" defaults to "Covariate".
X轴标签。如果plot.type="tc"默认为“时间”。如果plot.type="ct"默认为“协方差”。


参数：ylab
y-axis label. If plot.type="tc" defaults to "Covariate". If plot.type="ct" defaults to "Time".
y轴的标签。如果plot.type="tc"默认为“协方差”。如果plot.type="ct"默认为“时间”。


参数：main
The main title for the plot. By default no main title is added.
主标题的图。默认情况下没有主标题。


参数：sub
A sub title for the plot. By default no sub title is added.
子标题的图。默认情况下没有子标题。


参数：las
The style of labeling to be used. The default is to use horizontal labeling.
标签要使用的样式。默认情况下是使用卧式贴标。


参数：conf.int
Logical. Whether to display contour plots of confidence regions. Default is FALSE.
逻辑。是否显示信心区域的等高线图。默认值是false。


参数：legend
A logical specifying if a legend should be added.
一个逻辑规定，如果一个传奇。


参数：curvlab
A character or expression vector to appear in the legend. Default is the name of the transitions.
出现在传说中的字符或表达向量。默认值是过渡的名称。


参数：...
Further arguments for contour.
进一步的论据轮廓。


Details

详细信息----------Details----------

The device is divided by the number of transitions specified by argument tr.choice. Being the number of columns equal to the number of transitions. If argument conf.int=TRUE the device is further divided to make room for the confidence regions. In this case two rows are added, one for each side of the confidence region. So if conf.int=TRUE the center row provides the contour of the estimates. The upper row provides the upper side of the confidence region. And the lower row provides the lower side of the confidence region.
该设备被划分由数量参数tr.choice所指定的转换。作为转换的数量等于列的数量。如果参数conf.int=TRUE设备的进一步划分，使空间的置信区域。在这种情况下，两行添加，每一侧的信心区域之一。因此，如果conf.int=TRUE中心行估计的轮廓。上面的行提供的信心区域的上侧。和下侧的行提供的信心区域的下侧。


值----------Value----------

No value is returned.
无返回值。


（作者）----------Author(s)----------


Artur Agostinho Araujo, Javier Roca-Pardinas and Luis Meira Machado



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

contour.
contour。


实例----------Examples----------


# Create survTP object[survTP对象]
data(colonTP)
colonTP_obj <- with( colonTP, survTP(time1, event1, Stime, event, age) )

# Compute IPCW conditional transition probabilities without confidence band[计算IPCW没有信心带条件转移概率]
TPCmsm_obj <- transIPCW(colonTP_obj, s=57, t=310, x=0)

# Plot contour with Time in the x-axis[图轮廓与在x-轴的时间]
contour(TPCmsm_obj, plot.type="tc", tr.choice=c("1 1", "1 2", "2 2"), ylab="Age")

# Plot contour with Time in the y-axis[时间在y轴的图的轮廓。]
contour(TPCmsm_obj, plot.type="ct", tr.choice=c("1 1", "1 2", "1 3"), xlab="Age")

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