adjustP2(CALIB)
adjustP2()所属R语言包:CALIB
Adjust model parameter P2
调整模型参数P2
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Adjust the calibration model parameter P2 according to the measured intensities of all clones spotted on the array.
根据阵列上发现的所有克隆的测量强度,调整校准模型参数P2。
用法----------Usage----------
adjustP2(RG, parameter, arrayindex = arrayindex, colorindex = colorindex)
参数----------Arguments----------
参数:RG
an RGList object.
RGList对象。
参数:parameter
a ParameterList object.
ParameterList对象。
参数:arrayindex
integer vector specifying the index of the arrays of whose the parameter P2 needed to be adjusted.
整数向量指定的需要调整的参数P2的数组的索引。
参数:colorindex
integer vector specifying which color needed to be adjusted.
整数向量指定颜色需要进行调整。
Details
详情----------Details----------
RG is an RGList_CALIB object which contains all the experimental data. parameter is the return result of function estimateParameter. arrayindex is an integer vector. It gives the index of the arrays whose P2 is needed to be adjusted. colorindex is an integer vector. It gives the color needed to be adjusted. 1 means red P2 and 2 means green P2.
RG是RGList_CALIB对象,它包含了所有的实验数据。 parameter是estimateParameter.arrayindex是一个整数向量函数的返回结果。它给人的P2是需要调整的阵列,其索引。 colorindex是一个整数向量。它给了需要调整的颜色。 1意味着红P2和2是指绿色的P2。
值----------Value----------
It returns a ParameterList object with a adjusted P2 compared to the input argument parameter.
它返回一个调整的P2ParameterList对象相比,输入参数parameter。
注意----------Note----------
The user should decide on which array and which color the adjustment is needed. Therefore it is important to specify the right array index and color index. There is no check on this in the function.
用户应决定阵列和颜色的调整是必要的。因此,重要的是要指定数组索引和显色指数。是在功能上没有这方面的检查。
作者(S)----------Author(s)----------
Hui Zhao
举例----------Examples----------
# load data: RG and parameter:[负载数据:RG和参数:]
data(RG)
data(parameter)
# adjust P2[调整的P2]
parameter_new <- adjustP2(RG,parameter,arrayindex=c(1,2),colorindex=c(2,2))
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