weighted_richclub_tm(tnet)
weighted_richclub_tm()所属R语言包:tnet
The weighted rich-club effect (two-mode networks)
丰富的加权俱乐部的影响(双模式网络)
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function calculates the weighted rich-club coefficient proposed in Opsahl, T., Colizza, V., Panzarasa, P., Ramasco, J.J., 2008. Prominence and control: The weighted rich-club effect. PRL 101. It incorporates two extentions explained in this blog post http://toreopsahl.com/2009/05/29/weighted-rich-club-effect-a-more-appropriate-null-model-for-scientific-collaboration-networks/:<br> 1) a new way of reshuffling (two-mode link reshuffling; <br> 2) calculating significance levels if there are more than 100 random networks (see my PhD thesis; http://toreopsahl.com/publications/thesis/)
此函数计算的加权系数丰富的俱乐部,在:T.,OPSAHL,Colizza,V.,Panzarasa,P.,Ramasco,林俊杰,2008年提出。突出与控制:加权富国俱乐部的影响。 PRL 101。它包含两个扩张解释在这个博客帖子1)一种新的方式计算的洗牌(双模式链路重新洗牌,参考2)如果有超过100个随机网络的显着性水平(见我的博士论文; http://toreopsahl.com/publications/thesis/)
用法----------Usage----------
weighted_richclub_tm(net, NR=1000, seed=NULL, projection.method="Newman", nbins=30)
参数----------Arguments----------
参数:net
A binary two-mode edgelist
一个二进制模式EdgeList都,
参数:NR
number of random networks used.
使用随机网络。
参数:seed
the random generators seed, used to produce random yet reproducable results.
随机生成的种子,用于产生随机还重复性结果。
参数:projection.method
the method used to project the two-mode network to a weighted one-mode network: either "sum" or "Newman"
方法用于预测双模式网络的加权模式的网络:无论是“总和”或“纽曼”
参数:nbins
the number of bins in the output
在输出中箱的数目
值----------Value----------
Returns a table with the fraction of phi(observed) over phi(null). Nbins controls the number of rows.
返回一个表,披披岛(观察)(空)的分数。 nbins控制的行的数目。
注意----------Note----------
version 1.0.0
版本1.0.0
(作者)----------Author(s)----------
Tore Opsahl; http://toreopsahl.com
参考文献----------References----------
http://toreopsahl.com/2008/12/12/article-prominence-and-control-the-weighted-rich-club-effect/ <br>
实例----------Examples----------
## Load data[#加载数据]
data(tnet)
## Run the function on a subset[#执行功能的一个子集]
weighted_richclub_tm(Newman.Condmat.95.99.net.2mode[1:100,], NR=10)
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