R语言 BSgenome包 BSParams-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

BSParams-class(BSgenome)
BSParams-class()所属R语言包：BSgenome

                                        Class "BSParams"
                                         类“BSParams”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A parameter class for representing all parameters needed for running the bsapply method.
一个代表运行bsapply方法所需的所有参数的参数类。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("BSParams", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("BSParams", ...)。


插槽----------Slots----------

a BSgenome object that contains chromosomes that you wish to apply FUN on
1 BSgenome的对象，它包含的染色体，你想申请乐趣

the function to apply to each chromosome in the BSgenome object 'X'
适用于BSgenome对象的“X”每个染色体的功能

this is a character vector with strings that will be used to filter out chromosomes whose names match these strings.
这是一个将用于筛选出染色体的名字相匹配这些字符串的字符串的字符向量。

TRUE/FALSE value to indicate whether or not the function should try to simplify the output for you.
TRUE / FALSE值显示与否的功能应尽量简化你的输出。

A named logical vector of maskStates preferred when used with a BSGenome object.  When using the bsapply function, the masks will be set to the states in this vector.
命名的逻辑向量的首选用于与BSGenome对象时maskStates。口罩当使用bsapply功能，将会为美国在这个向量。

A character vector which should contain motifs that the user wishes to mask from the sequence.
应包含一个字符向量图案，用户希望从序列来掩盖。

A RangesList object, where each element masks the corresponding chromosome in X. This allows the user to conveniently apply masks besides those included in X.
一个RangesList对象，其中每个元素口罩在X相应的染色体。这使得用户可以方便地适用于那些面具，除了包含在X。

A logical indicating whether to invert each mask in userMask.
一个logical指示是否反转每个面具userMask。


方法----------Methods----------




bsapply(p) Performs the function FUN using the
bsapply(p)执行使用的函数fun


作者（S）----------Author(s)----------


Marc Carlson



参见----------See Also----------

bsapply
bsapply

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。