maxGap-method(biovizBase)
maxGap-method()所属R语言包:biovizBase
Estimated max gaps
预计最大的差距
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Compute an estimated max gap information, which could
计算估计的最大差距的信息,这可能
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'GenomicRanges'
maxGap(obj, ratio = 0.0025)
参数----------Arguments----------
参数:obj
GenomicRanges object
GenomicRanges对象
参数:ratio
Multiple by the range of the provided gaps as the max gap.
多个范围内所提供的最大差距差距。
Details
详情----------Details----------
This function tries to estimate an appropriate max gap
这个函数试图估算适当的最大差距
值----------Value----------
A numeric value
数值
作者(S)----------Author(s)----------
Tengfei Yin
参见----------See Also----------
shrinkageFun
shrinkageFun
举例----------Examples----------
gr1 <- GRanges("chr1", IRanges(start = c(100, 300, 600),
end = c(200, 400, 800)))
gr2 <- GRanges("chr1", IRanges(start = c(100, 350, 550),
end = c(220, 500, 900)))
gaps.gr <- intersect(gaps(gr1, start = min(start(gr1))),
gaps(gr2, start = min(start(gr2))))
shrink.fun <- shrinkageFun(gaps.gr, max.gap = maxGap(gaps.gr))
shrink.fun(gr1)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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