R语言 Biostrings包 XStringQuality-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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XStringQuality-class(Biostrings)
XStringQuality-class()所属R语言包：Biostrings

                                        PhredQuality and SolexaQuality objects
                                         的PhredQuality和SolexaQuality对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Objects for storing string quality measures.
对象存储字符串质量的措施。


用法----------Usage----------


## Constructors:
PhredQuality(x)
SolexaQuality(x)



参数----------Arguments----------

参数：x
Either a character vector, BString, BStringSet, integer vector, or number vector of error probabilities.  
无论是一个特征向量，BString，BStringSet，整数向量，或数字向量的错误概率。


Details

详情----------Details----------

PhredQuality objects store characters that are interpreted as [0 - 99] quality measures by subtracting 33 from their ASCII decimal representation (e.g. ! = 0, " = 1, \# = 2, ...).
PhredQuality对象存储字符解释为[0  -  99]质量的措施，从他们的ASCII十进制表示形式（例如：= 0，“= 1，\＃= 2，...！）减去33。

SolexaQuality objects store characters are interpreted as [-5 - 99] quality measures by subtracting 64 from their ASCII decimal representation (e.g. ; = -5, < = -4, = = -3, ...).
SolexaQuality对象存储字符解释为[-5  -  99]质量的措施，从他们的ASCII十进制表示减去64（例如：= -5 <= -4，== -3，...）。


作者（S）----------Author(s)----------


P. Aboyoun



参见----------See Also----------

pairwiseAlignment, PairwiseAlignedXStringSet-class, DNAString-class, BStringSet-class
pairwiseAlignment，PairwiseAlignedXStringSet级，级DNAString，BStringSet级


举例----------Examples----------


  PhredQuality(0:40)
  SolexaQuality(0:40)

  PhredQuality(seq(1e-4,0.5,length=10))
  SolexaQuality(seq(1e-4,0.5,length=10))

  x <- SolexaQuality(BStringSet(c(a="@ABC", b="abcd")))
  as.matrix(x)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。