toComplex(Biostrings)
toComplex()所属R语言包:Biostrings
Turning a DNA sequence into a vector of complex numbers
变成了复数向量的DNA序列
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The toComplex utility function turns a DNAString object into a complex vector.
toComplex实用功能变成一个复杂的矢量1 DNAString对象。
用法----------Usage----------
toComplex(x, baseValues)
参数----------Arguments----------
参数:x
A DNAString object.
一个DNAString对象。
参数:baseValues
A named complex vector containing the values associated to each base e.g. c(A=1+0i, G=0+1i, T=-1+0i, C=0-1i)
命名的复杂向量,每个碱基,如关联值c(A=1+0i, G=0+1i, T=-1+0i, C=0-1i)
值----------Value----------
A complex vector of the same length as x.
一个复杂的矢量相同的长度为x。
作者(S)----------Author(s)----------
H. Pages
参见----------See Also----------
DNAString
DNAString
举例----------Examples----------
seq <- DNAString("accacctgaccattgtcct")
baseValues1 <- c(A=1+0i, G=0+1i, T=-1+0i, C=0-1i)
toComplex(seq, baseValues1)
## GC content:[#GC含量:]
baseValues2 <- c(A=0, C=1, G=1, T=0)
sum(as.integer(toComplex(seq, baseValues2)))
## Note that there are better ways to do this (see ?alphabetFrequency)[#请注意,有更好的方法来做到这一点(见alphabetFrequency)]
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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