R语言 Biostrings包 QualityScaledXStringSet-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

QualityScaledXStringSet-class(Biostrings)
QualityScaledXStringSet-class()所属R语言包：Biostrings

                                        QualityScaledBStringSet, QualityScaledDNAStringSet, QualityScaledRNAStringSet and QualityScaledAAStringSet objects
                                         QualityScaledBStringSet，QualityScaledDNAStringSet，QualityScaledRNAStringSet和QualityScaledAAStringSet对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The QualityScaledBStringSet class is a container for storing a BStringSet object with an XStringQuality object.
QualityScaledBStringSet类是为存储BStringSet对象的XStringQuality对象的容器。

Similarly, the QualityScaledDNAStringSet (or QualityScaledRNAStringSet, or QualityScaledAAStringSet) class is a container for storing a DNAStringSet (or RNAStringSet, or AAStringSet) objects with an XStringQuality object.
同样，在QualityScaledDNAStringSet（或QualityScaledRNAStringSet，或QualityScaledAAStringSet的）类是一个用于存储容器DNAStringSet（或RNAStringSet或AAStringSet）XStringQuality对象的对象。


用法----------Usage----------


## Constructors:
QualityScaledBStringSet(x, quality)
QualityScaledDNAStringSet(x, quality)
QualityScaledRNAStringSet(x, quality)
QualityScaledAAStringSet(x, quality)



参数----------Arguments----------

参数：x
Either a character vector, or an XString, XStringSet or XStringViews object.  
无论是矢量字符，或XString，XStringSet或XStringViews对象。


参数：quality
An XStringQuality object.  
一个XStringQuality对象。


Details

详情----------Details----------

The QualityScaledBStringSet, QualityScaledDNAStringSet, QualityScaledRNAStringSet and QualityScaledAAStringSet functions are constructors that can be used to "naturally" turn x into an QualityScaledXStringSet object of the desired base type.
QualityScaledBStringSet，QualityScaledDNAStringSet，QualityScaledRNAStringSet和QualityScaledAAStringSet功能是可以使用的“自然”转x到所需的基础QualityScaledXStringSet对象构造类型。


存取方法----------Accessor methods----------

The QualityScaledXStringSet class derives from the XStringSet class hence all the accessor methods defined for an XStringSet object can also be used on an QualityScaledXStringSet object. Common methods include (in the code snippets below, x is an QualityScaledXStringSet object):
QualityScaledXStringSet类派生的XStringSet类，因此所有的存取为XStringSet对象定义的方法也可用于上QualityScaledXStringSet对象。常用的方法包括（在下面的代码片段，x是QualityScaledXStringSet的对象）：

length(x): The number of sequences in x.
length(x)：序列x的数目。

width(x): A vector of non-negative integers containing the number of letters for each element in x.
width(x)：包含在x每个元素的字母数量的非负整数向量。

nchar(x): The same as width(x).
nchar(x)：width(x)。

names(x): NULL or a character vector of the same length as x containing a short user-provided description or comment for each element in x.
names(x)：NULL或x包含用户提供的在x每个元素的简短说明或评论的长度相同的特征向量。

quality(x): The quality of the strings.
quality(x)：琴弦的质量。


子集和追加----------Subsetting and appending----------

In the code snippets below, x and values are XStringSet objects, and i should be an index specifying the elements to extract.
在下面的代码片段，x和values是XStringSet的对象，i应该是一个指定的元素提取的指数。

x[i]: Return a new QualityScaledXStringSet object made of the selected elements.
x[i]：返回新QualityScaledXStringSet的对象选定的元素。


作者（S）----------Author(s)----------


P. Aboyoun



参见----------See Also----------

BStringSet-class, DNAStringSet-class, RNAStringSet-class, AAStringSet-class, XStringQuality-class
级RNAStringSet，级DNAStringSet，BStringSet-级，级AAStringSet，XStringQuality级


举例----------Examples----------


  x1 <- DNAStringSet(c("TTGA", "CTCN"))
  q1 <- PhredQuality(c("*+,-", "6789"))
  qx1 <- QualityScaledDNAStringSet(x1, q1)
  qx1

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。