matchWCP(Biostrings)
matchWCP()所属R语言包：Biostrings
A simple WCP matching function and related utilities
一个简单的WCP的配套功能和相关的实用程序
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A function implementing a simple algorithm for matching a set of patterns represented by Weighted Clustered Positions (WCP) to an XString sequence.
实施了一套加权聚集的位置（WCP）到XString序列所代表的模式匹配算法简单的一个功能。
用法----------Usage----------
matchWCP(wcp, subject, min.score="80%")
countWCP(wcp, subject, min.score="80%")
WCPscoreStartingAt(wcp, subject, starting.at=1)
参数----------Arguments----------
参数：wcp
A WCP object.
一个WCP的对象。
参数：subject
An XString, XStringViews or MaskedXString object for matchWCP and countWCP. A XString object for WCPscoreStartingAt.
28一个XString，XStringViews或MaskedXStringmatchWCP和countWCP的对象。一个的WCPscoreStartingAtXString对象。
参数：min.score
The minimum score for counting a match. Can be given as a character string containing a percentage (e.g. "85%") of the highest possible score or as a single number.
计数匹配的最低得分。可以作为一个字符的字符串包含一个百分比（例如"85%"）可能达到的最高得分，或作为一个单一的数字。
参数：starting.at
An integer vector specifying the starting positions of the Weighted Clustered Positions relatively to the subject.
整数向量加权聚类相对位置的主题指定的起始位置。
值----------Value----------
An XStringViews object for matchWCP.
matchWCPXStringViews对象。
A single integer for countWCP.
一个单一的整数countWCP。
A numeric vector containing the Weighted Clustered Positions-based scores for WCPscoreStartingAt.
数值向量聚集的位置为基础的加权分数为WCPscoreStartingAt。
作者（S）----------Author(s)----------
P. Aboyoun
参见----------See Also----------
matchPWM, matchPattern, WCP-class, XString-class, XStringViews-class
matchPWM，matchPattern，WCP的类，XString级，XStringViews级
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
|
发表于 2012-2-25 13:47:38
