R语言 BioSeqClass包 featureDIPRODB()函数中文帮助文档(中英文对照)

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featureDIPRODB(BioSeqClass)
featureDIPRODB()所属R语言包：BioSeqClass

                                        Feature Coding by Dinucleotide Property
                                         由核苷酸物业特征编码

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Sequences are coded by conformational or thermodynamic dinucleotide property from  DiProDB database.
编码序列的构象或热力学DiProDB数据库的核苷酸财产。


用法----------Usage----------


  featureDIPRODB(seq, na.type="all", na.strand="all", diprodb.method="all",
    diprodb.type="all")



参数----------Arguments----------

参数：seq
a string vector for the protein, DNA, or RNA sequences.   
为蛋白质，DNA或RNA序列的字符串向量。


参数：na.type
a string for nucleic acid type. It must be "DNA", "DNA/RNA", "RNA",  or "all".
核酸类型的字符串。它必须的“DNA”，“DNA / RNA的”，“核糖核酸”，或“所有”。


参数：na.strand
a string for strand information. It must be "double", "single",  or "all".
一串链信息。它必须是“双”，“单”，或“所有”。


参数：diprodb.method
a string for mode of property determination. It can be  "experimental", "calculated", or "all".
认定财产无模式的字符串。它可以是“实验”，“计算”，或“所有”。


参数：diprodb.type
a string for property type. It can be "physicochemical",  "conformational", "letter based", or "all".
属性类型的字符串。它可以是“物化”，“构”，“信”，或“所有”。


Details

详情----------Details----------

featureDIPRODB returns a matrix with 122 columns. Each column is the mean of conformational or thermodynamic dinucleotide property from  DiProDB database (http://diprodb.fli-leibniz.de).  
featureDIPRODB返回一个矩阵有122列。每列平均构或热力学从DiProDB数据库（http://diprodb.fli-leibniz.de）的核苷酸财产。


作者（S）----------Author(s)----------


Hong Li



举例----------Examples----------


if(interactive()){
  file = file.path(.path.package("BioSeqClass"), "example", "test.rna")   
  rna = as.matrix(read.csv(file,header=F,sep="\t"))[,1]
  
  DIPRODB1 = featureDIPRODB(rna)
  DIPRODB2 = featureDIPRODB(rna, na.type="RNA")
}

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