readHeinzTree(BioNet)
readHeinzTree()所属R语言包:BioNet
Convert HEINZ output to tree
亨氏输出转换到树
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Converts the HEINZ output to a tree in graph format. If the output is in matrix form, it will create a list of graphs. The function needs the node and edge file and the original network from which the module is calculated.
将亨氏输出转换图形格式的树。如果输出是矩阵形式,它会创建一个图的列表。该功能需要的节点和边的文件和原有的网络计算模块。
用法----------Usage----------
readHeinzTree(node.file, edge.file, network, format=c("graphNEL", "igraph"))
参数----------Arguments----------
参数:node.file
Heinz node output file.
亨氏节点的输出文件。
参数:edge.file
Heinz edge output file.
亨氏边缘输出文件。
参数:network
Original network from which Heinz input was created.
从亨氏输入创建的原始网络。
参数:format
Output format of the graph, either igraph or graphNEL.
输出格式的图形,无论是IGRAPH或graphNEL。
值----------Value----------
A graph object.
一个图形对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Daniela Beisser
举例----------Examples----------
library(DLBCL)
data(interactome)
# precomputed Heinz output files[预计算亨氏输出文件]
## Not run: lib <- file.path(.path.package("BioNet"), "extdata") [#无法运行库< - file.path(path.package(“生物网”),“extdata”)]
module <- readHeinzTree(node.file=file.path(lib, "lymphoma_nodes_001.txt.0.hnz"), edge.file=file.path(lib, "lymphoma_edges_001.txt.0.hnz"), network=interactome, format="graphNEL");
plotModule(module);
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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