R语言 BioNet包 mapByVar()函数中文帮助文档(中英文对照)

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mapByVar(BioNet)
mapByVar()所属R语言包：BioNet

                                         Select probeset by variance and get PPI ID
                                         选择通过方差probeset，获得PPI ID

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function selects for each gene the probeset with the highest variance and gets the PPI ID for each gene. The PPI identifier is: gene symbol(Entrez ID). Affymetrix identifiers are mapped to the ENTREZ ID.
每个基因的功能选择probeset最高的方差，获得每个基因的PPI ID。 PPI标识符是：基因符号（Entrez的编号）。 Affymetrix公司的标识符被映射到Entrez的ID。


用法----------Usage----------


mapByVar(exprSet, network=NULL, attr="geneID", ignoreAFFX=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：exprSet
Affymetrix ExpressionSet.  
Affymetrix公司ExpressionSet。


参数：network
Network that is used to map the Affymetrix identifiers.
网络，用于映射的Affymetrix标识符。


参数：attr
The attribute of the network that is used to map the Affymetrix IDs. The IDs are mapped to the unique Entrez gene IDs, which are by default stored in the "geneID" attribute of the network.
用于Affymetrix公司的ID映射的网络属性。独特的Entrez基因标识，这是默认的的“geneID”网络属性中存储的ID映射。


参数：ignoreAFFX
Boolean value, whether to ignore or leave AFFX control genes.
布尔值，是否忽略或离开AFFX控制基因。


值----------Value----------

Expression matrix with one gene (PPI ID) per probeset.
（PPI的编号）每probeset基因的表达矩阵。


作者（S）----------Author(s)----------



Daniela Beisser




举例----------Examples----------


## Not run: library(ALL);[＃运行库（全部）;]
data(ALL);
mapped.e.set <- mapByVar(ALL);
mapped.e.set[1:10,];
## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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