fdrThreshold(BioNet)
fdrThreshold()所属R语言包:BioNet
Calculate p-value threshold for given FDR
计算p值给FDR的阈值
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function calculates the p-value threshold tau for a given false discovery rate. Tau is used for the scoring function.
函数计算p值,对于一个给定的错误发现率阈值头。头用于打分函数。
用法----------Usage----------
fdrThreshold(fdr, fb)
参数----------Arguments----------
参数:fdr
False discovery rate.
虚假的发现率。
参数:fb
Model from the beta-uniform mixture fitting.
从β-均匀混合拟合模型。
值----------Value----------
P-value threshold tau.
P值的阈值头。
作者(S)----------Author(s)----------
Marcus Dittrich
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
fbum, fitBumModel
fbum,fitBumModel
举例----------Examples----------
data(pvaluesExample)
pvals <- pvaluesExample[,1]
bum.mle <- fitBumModel(pvals, plot=FALSE)
tau <- fdrThreshold(fdr=0.001, fb=bum.mle)
tau
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