R语言 BioNet包 bumOptim()函数中文帮助文档(中英文对照)

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bumOptim(BioNet)
bumOptim()所属R语言包：BioNet

                                          Fitting a beta-uniform mixture model to p-value distribution
                                         P-值分布拟合β-均匀混合模型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function fits a beta-uniform mixture model to a given p-value distribution.
该功能适合β-均匀混合模型到一个给定的p值分布。


用法----------Usage----------


bumOptim(x, starts=1, labels=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：x
Numerical vector of p-values, has to be named with the gene names or the gene names can be given in the labels paramater.   
p值的数值向量，已被命名的基因名称或基因的名称，可以在标签paramater。


参数：starts
Number of start points for the optimization.  
优化的起点。


参数：labels
Gene names for the p-values.  
p值的基因名称。


值----------Value----------

List of class fb with the following elements:
FB类名单包含下列元素：


参数：lambda
Fitted parameter lambda for the beta-uniform mixture model.
β-均匀混合模型的拟合参数的lambda。


参数：a
Fitted parameter a for the beta-uniform mixture model.
拟合参数为β-均匀混合模型。


参数：negLL
Negative log-likelihood.
负面记录的可能性。


参数：pvalues
P-value vector.
P-值向量。


作者（S）----------Author(s)----------


Marcus Dittrich and Daniela Beisser



参考文献----------References----------




参见----------See Also----------

fitBumModel, plot.bum, hist.bum
fitBumModel，plot.bum，hist.bum


举例----------Examples----------


data(pvaluesExample)
pvals <- pvaluesExample[,1]
bum <- bumOptim(x=pvals, starts=10)
bum

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