Class "GSE": A class to represent gene set enrichment data
类“GSE”代表基因组富集的数据:A级
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
GSE is a class to represent gene set enrichment data and will be used in the modelData slot in the gseModel object. This class will store all of the information that pertains to performing gene set enrichment.
GSE的一个类来表示基因组富集的数据和将用于在gseModel对象modelData插槽。这个类将所有存储的信息,涉及到进行基因组富集。
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects can be created by calls of the form new("GSE", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("GSE", ...)。
插槽----------Slots----------
incidMat: the incidence matrix that shows the relationship
incidMat:显示关系的关联矩阵
gTestStat: the test statistic for the genes relationship
gTestStat:为检验统计量的基因关系
gsTestStat: the test statistic for the gene set
gsTestStat:基因组的测试统计
expData: the experimental data (here it will be of class ExpressionSet)
expData:实验数据(这里将是类ExpressionSet)
descr: a description of the gene set being studied
descr:正在研究基因组的说明
方法----------Methods----------
incidMat<- Sets the incidMat slot
incidMat < - 设置incidMat插槽
incidMat Returns the incidMat slot
incidMat返回incidMat插槽
gTestStat<- Sets the gTestStat slot
gTestStat < - 设置gTestStat插槽
gTestStat Returns the gTestStat slot
gTestStat返回gTestStat插槽
gsTestStat<- Sets the gsTestStat slot
gsTestStat < - 设置gsTestStat插槽
gsTestStat Returns the gsTestStat slot
gsTestStat返回gsTestStat插槽
expData<- Sets the expData slot
expData < - 设置expData插槽
expData Returns the expData slot
expData返回expData插槽